24小时热门版块排行榜    

查看: 1860  |  回复: 7
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

lightgjx

木虫 (正式写手)

[求助] vasp 集群并行出错

我的集群编译共两台机子,其中一台为主服务器(主机名:node1),另外一台作为客户端(node2),在并行编译过程中按照网上的编译方法都已经成功,包括机子之间访问无障碍,安装mpich2,启动mpd(单机+多机都成功),实现了服务器/home共享,在客户机挂载/home都没有问题,但一旦开始运行遇到两个问题:
1、用mpirun -np 4 ./cpi  命令的时候出现以下错误:
MPIR_Init_thread(188): Initialization failed
MPID_Init(118): channel initialization failed
MPIDI_CH3_Init(402): process not on the same host (node2 != node1)
rank 1 in job 1  scc-m_37184   caused collective abort of all ranks
  exit status of rank 1: return code 13
2、用mpiexec -machinefile  machinefile -n 4 ./cpi 出现以下错误:
invalid mpiexec argument -machinefile
Usage: mpiexec -n -soft -host \
               -wdir -path \
               -file -configfile execname \
               [ : -n ... execname ]
这里为什么-machinefile参数不存在呀????,另外使用-host参数的时候和没有用没什么区别。

还请高手指教那里出了问题。谢谢大家。困扰了很长时间了。谢谢大家。

[ Last edited by lightgjx on 2012-7-8 at 07:30 ]
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lightgjx

木虫 (正式写手)

引用回帖:
4楼: Originally posted by 04nylxb at 2012-07-08 20:46:31
用mpiexec的时候,要建立一个hydronodes的file,而不是machinefile,同时用把这个文件加到环境变量里面去。

加入环境变量的具体操作是怎么样的。我怎么还是实现不了呀。另外,请问你知道我的第一个错误时怎么回事吗。
5楼2012-07-08 22:03:18
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 8 个回答

snail594

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
xueht987: 金币+1, 多谢指教,鼓励交流! 2012-07-08 15:37:38
mpich2的参数应该是-f或者-file,你试试看,你这个是open-mpi的参数
Inlearningwetrust
2楼2012-07-08 10:25:29
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lightgjx

木虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by snail594 at 2012-07-08 10:25:29
mpich2的参数应该是-f或者-file,你试试看,你这个是open-mpi的参数

还是不行:错误如下:
[nis@scc-m ~]$  mpiexec -f machinefile  -np 4 /home/nis/mpich20/examples/cpi
invalid mpiexec argument -f
Usage: mpiexec -n -soft -host \
               -wdir -path \
               -file -configfile execname \
               [ : -n ... execname ]

[nis@scc-m ~]$  mpiexec -file machinefile  -np 4 /home/nis/mpich20/examples/cpi
invalid mpiexec argument -file
Usage: mpiexec -n -soft -host \
               -wdir -path \
               -file -configfile execname \
               [ : -n ... execname ]
3楼2012-07-08 11:26:23
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

04nylxb

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
用mpiexec的时候,要建立一个hydronodes的file,而不是machinefile,同时用把这个文件加到环境变量里面去。
集中精力发文章
4楼2012-07-08 20:46:31
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 售SCI一区文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +3 ASdOkHsho7FD 2026-08-28 5/250 2026-08-29 05:13 by gy1nBQXYQJqL
[基金申请] 我就是申请一个面上项目而已,这评审意见是按照杰青的条件评的吧? +4 gouxfjh 2026-08-28 4/200 2026-08-29 04:46 by alongwaytogo
[硕博家园] 售SCI一区文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +3 ASdOkHsho7FD 2026-08-28 4/200 2026-08-29 04:18 by gy1nBQXYQJqL
[教师之家] 售SCI-T0P文章,我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 ASdOkHsho7FD 2026-08-28 4/200 2026-08-29 04:06 by gy1nBQXYQJqL
[基金申请] 投票:  有多少人是今天查系统知道结果的? +16 爱看书的可乐 2026-08-26 18/900 2026-08-29 00:28 by winsaint
[基金申请] 为什么资助数各大高校都创新高,自己申请怎么就这么难 +12 Kittylucky 2026-08-27 13/650 2026-08-29 00:04 by superceng
[基金申请] 有没有仍没收到信息的 +3 德尚中行 2026-08-27 3/150 2026-08-28 15:24 by rongshuxia
[教师之家] 导师吐槽:我怎么摊上了这么个极品研究生! +8 苏东坡二世 2026-08-23 8/400 2026-08-28 14:41 by lkforward
[基金申请] 基金不中,共勉 +11 eulota 2026-08-26 11/550 2026-08-28 14:22 by 火星超人xi
[基金申请] 麻烦专家们看看评委们的意见(F口面上) +4 gdd2018 2026-08-28 9/450 2026-08-28 14:22 by jklily
[基金申请] 基金系统什么内容也没有 30+4 winsaint 2026-08-27 9/450 2026-08-28 11:06 by maolC
[基金申请] 怎么查啊 +6 huang1991js 2026-08-26 6/300 2026-08-28 08:42 by winsaint
[基金申请] 2026年的国家社科基金项目通讯评审的新规则与新动向、新挑战 +7 process2012 2026-08-23 10/500 2026-08-26 19:23 by hmhminy
[基金申请] 2026年8月25日国自然放榜前突然收到列入评审专家邮件,有关系吗? +25 木水思豆 2026-08-25 28/1400 2026-08-26 14:53 by draco1987
[基金申请] 国合里面能看到了 +7 一怀馨秋 2026-08-26 7/350 2026-08-26 11:23 by zhaosm1982
[基金申请] 系统进不去 +4 yanglien 2026-08-26 5/250 2026-08-26 11:10 by wenfengw83
[基金申请] 项目信息和经费信息在系统里都可以看到了 +6 wittyboy 2026-08-26 14/700 2026-08-26 10:55 by wittyboy
[基金申请] 国合可查了 +3 paperzjh 2026-08-26 3/150 2026-08-26 10:41 by LemmonTr
[基金申请] 国合现在查不到了吗? +10 chengyan1220 2026-08-24 20/1000 2026-08-26 08:57 by peasantsprig
[教师之家] 跳槽后在研项目怎么办? +5 简单化xn 2026-08-22 10/500 2026-08-23 12:38 by 简单化xn
信息提示
请填处理意见