| 查看: 3028 | 回复: 17 | ||
| 当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖 | ||
stefsui木虫 (小有名气)
|
[求助]
新手vasp编译不过，请指教～
|
|
|
环境redhat 64位 cpu ：Q6600 想要安装并行vasp 先装的ifort 没问题，之后安装MKL和openmpi，按照http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=4601283 中编译了fftw 0.编译MKL中的fftw 3.x Fortran wrapper library “ cd /opt/intel/mkl/10.1.0.015/interfaces/fftw3xf make libem64t compiler=intel 如果没有安装icc的话,需要使用gcc,则 make libem64t compiler=gnu” 我把其中的libem64t改为intel64 安装的gcc，所以使用了 make libintel64 compiler=gnu 之后编译 vasp.5.lib，make没有问题 vasp.5.2下makefile文件也参考了上面的教程 .SUFFIXES: .inc .f .f90 .F SUFFIX=.f90 FC=mpif90 FCL=$(FC) CPP_ = ./preprocess <$*.F | /usr/bin/cpp -P -C -traditional >$*$(SUFFIX) CPP = $(CPP_) -DMPI -DHOST=\"LinuxIFC\" -DIFC \ -Dkind8 -DCACHE_SIZE=4000 -DPGF90 -Davoidalloc -DNGZhalf \ -DMPI_BLOCK=8000 \ -DRPROMU_DGEMV -DRACCMU_DGEMV -DscaLAPACK FFLAGS = -I/opt/intel/mkl/include/fftw -FR -lower_case OFLAG=-O3 OFLAG_HIGH = $(OFLAG) OBJ_HIGH = OBJ_NOOPT = DEBUG = -FR -O0 INLINE = $(OFLAG) BLAS= -L/opt/intel/mkl/lib/intel64 -lmkl_intel_lp64 -lmkl_sequential -lmkl_core -lpthread LAPACK= -L/opt/intel/mkl/lib/intel64 -lmkl_intel_lp64 -lmkl_sequential -lmkl_core -lpthread SCA= /opt/intel/mkl/lib/intel64/libmkl_scalapack_lp64.a /opt/intel/mkl/lib/intel/libmkl_blacs_openmpi_lp64.a LIB = -L../vasp.5.lib -ldmy \ ../vasp.5.lib/linpack_double.o $(LAPACK) \ $(SCA) $(BLAS) FFT3D = fftmpi.o fftmpi_map.o fftw3d.o fft3dlib.o /opt/intel/mkl/lib/intel64/libfftw3xf_intel.a #----------------------------------------------------------------------- # general rules and compile lines #----------------------------------------------------------------------- BASIC= symmetry.o symlib.o lattlib.o random.o SOURCE= base.o mpi.o smart_allocate.o xml.o \ constant.o jacobi.o main_mpi.o scala.o \ asa.o lattice.o poscar.o ini.o xclib.o xclib_grad.o \ radial.o pseudo.o mgrid.o gridq.o ebs.o \ mkpoints.o wave.o wave_mpi.o wave_high.o \ $(BASIC) nonl.o nonlr.o nonl_high.o dfast.o choleski2.o \ mix.o hamil.o xcgrad.o xcspin.o potex1.o potex2.o \ metagga.o constrmag.o cl_shift.o relativistic.o LDApU.o \ paw_base.o egrad.o pawsym.o pawfock.o pawlhf.o paw.o \ mkpoints_full.o charge.o dipol.o pot.o \ dos.o elf.o tet.o tetweight.o hamil_rot.o \ steep.o chain.o dyna.o sphpro.o us.o core_rel.o \ aedens.o wavpre.o wavpre_noio.o broyden.o \ dynbr.o rmm-diis.o reader.o writer.o tutor.o xml_writer.o \ brent.o stufak.o fileio.o opergrid.o stepver.o \ chgloc.o fast_aug.o fock.o mkpoints_change.o sym_grad.o \ mymath.o internals.o dimer_heyden.o dvvtrajectory.o vdwforcefield.o \ hamil_high.o nmr.o force.o \ pead.o subrot.o subrot_scf.o pwlhf.o gw_model.o optreal.o davidson.o \ electron.o rot.o electron_all.o shm.o pardens.o paircorrection.o \ optics.o constr_cell_relax.o stm.o finite_diff.o elpol.o \ hamil_lr.o rmm-diis_lr.o subrot_cluster.o subrot_lr.o \ lr_helper.o hamil_lrf.o elinear_response.o ilinear_response.o \ linear_optics.o linear_response.o \ setlocalpp.o wannier.o electron_OEP.o electron_lhf.o twoelectron4o.o \ ratpol.o screened_2e.o wave_cacher.o chi_base.o wpot.o local_field.o \ ump2.o bse.o acfdt.o chi.o sydmat.o INC= vasp: $(SOURCE) $(FFT3D) $(INC) main.o rm -f vasp $(FCL) -o vasp main.o $(SOURCE) $(FFT3D) $(LIB) $(LINK) makeparam: $(SOURCE) $(FFT3D) makeparam.o main.F $(INC) $(FCL) -o makeparam $(LINK) makeparam.o $(SOURCE) $(FFT3D) $(LIB) zgemmtest: zgemmtest.o base.o random.o $(INC) $(FCL) -o zgemmtest $(LINK) zgemmtest.o random.o base.o $(LIB) dgemmtest: dgemmtest.o base.o random.o $(INC) $(FCL) -o dgemmtest $(LINK) dgemmtest.o random.o base.o $(LIB) ffttest: base.o smart_allocate.o mpi.o mgrid.o random.o ffttest.o $(FFT3D) $(INC) $(FCL) -o ffttest $(LINK) ffttest.o mpi.o mgrid.o random.o smart_allocate.o base.o $(FFT3D) $(LIB) kpoints: $(SOURCE) $(FFT3D) makekpoints.o main.F $(INC) $(FCL) -o kpoints $(LINK) makekpoints.o $(SOURCE) $(FFT3D) $(LIB) clean: -rm -f *.g *.f *.o *.L *.mod ; touch *.F main.o: main$(SUFFIX) $(FC) $(FFLAGS)$(DEBUG) $(INCS) -c main$(SUFFIX) xcgrad.o: xcgrad$(SUFFIX) $(FC) $(FFLAGS) $(INLINE) $(INCS) -c xcgrad$(SUFFIX) xcspin.o: xcspin$(SUFFIX) $(FC) $(FFLAGS) $(INLINE) $(INCS) -c xcspin$(SUFFIX) makeparam.o: makeparam$(SUFFIX) $(FC) $(FFLAGS)$(DEBUG) $(INCS) -c makeparam$(SUFFIX) makeparam$(SUFFIX): makeparam.F main.F # # MIND: I do not have a full dependency list for the include # and MODULES: here are only the minimal basic dependencies # if one strucuture is changed then touch_dep must be called # with the corresponding name of the structure # base.o: base.inc base.F mgrid.o: mgrid.inc mgrid.F constant.o: constant.inc constant.F lattice.o: lattice.inc lattice.F setex.o: setexm.inc setex.F pseudo.o: pseudo.inc pseudo.F poscar.o: poscar.inc poscar.F mkpoints.o: mkpoints.inc mkpoints.F wave.o: wave.inc wave.F nonl.o: nonl.inc nonl.F nonlr.o: nonlr.inc nonlr.F $(OBJ_HIGH): $(CPP) $(FC) $(FFLAGS) $(OFLAG_HIGH) $(INCS) -c $*$(SUFFIX) $(OBJ_NOOPT): $(CPP) $(FC) $(FFLAGS) $(INCS) -c $*$(SUFFIX) fft3dlib_f77.o: fft3dlib_f77.F $(CPP) $(F77) $(FFLAGS_F77) -c $*$(SUFFIX) .F.o: $(CPP) $(FC) $(FFLAGS) $(OFLAG) $(INCS) -c $*$(SUFFIX) .F$(SUFFIX): $(CPP) $(SUFFIX).o: $(FC) $(FFLAGS) $(OFLAG) $(INCS) -c $*$(SUFFIX) # special rules #----------------------------------------------------------------------- # these special rules are cummulative (that is once failed # in one compiler version, stays in the list forever) # -tpp5|6|7 P, PII-PIII, PIV # -xW use SIMD (does not pay of on PII, since fft3d uses double prec) # all other options do no affect the code performance since -O1 is used fft3dlib.o : fft3dlib.F $(CPP) $(FC) -FR -lowercase -O2 -c $*$(SUFFIX) fft3dfurth.o : fft3dfurth.F $(CPP) $(FC) -FR -lowercase -O1 -c $*$(SUFFIX) radial.o : radial.F $(CPP) $(FC) -FR -lowercase -O1 -c $*$(SUFFIX) symlib.o : symlib.F $(CPP) $(FC) -FR -lowercase -O1 -c $*$(SUFFIX) symmetry.o : symmetry.F $(CPP) $(FC) -FR -lowercase -O1 -c $*$(SUFFIX) wave_mpi.o : wave_mpi.F $(CPP) $(FC) -FR -lowercase -O1 -c $*$(SUFFIX) wave.o : wave.F $(CPP) $(FC) -FR -lowercase -O1 -c $*$(SUFFIX) dynbr.o : dynbr.F $(CPP) $(FC) -FR -lowercase -O1 -c $*$(SUFFIX) asa.o : asa.F $(CPP) $(FC) -FR -lowercase -O1 -c $*$(SUFFIX) broyden.o : broyden.F $(CPP) $(FC) -FR -lowercase -O2 -c $*$(SUFFIX) us.o : us.F $(CPP) $(FC) -FR -lowercase -O1 -c $*$(SUFFIX) LDApU.o : LDApU.F $(CPP) $(FC) -FR -lowercase -O2 -c $*$(SUFFIX) 只更改了mkl的路径，现在的错误是 make: *** No rule to make target `/opt/intel/mkl/lib/intel64/libfftw3xf_intel.a', needed by `vasp'. Stop. 我没找到libfftw3xf_intel.a ，是编译fftw的问题吗？ 求指教 [ Last edited by stefsui on 2012-7-2 at 23:48 ] |
回复此楼» 猜你喜欢
复试调剂，一志愿南农083200食品科学与工程
已经有4人回复
-
一志愿太原理工安全工程300分，求调剂
已经有3人回复
-
284求调剂
已经有11人回复
-
食品工程专硕求调剂
已经有3人回复
-
324求调剂
已经有7人回复
-
一志愿武汉理工，总分321，英一数二，求老师收留。
已经有4人回复
-
287求调剂
已经有7人回复
-
325求调剂
已经有5人回复
-
343求调剂
已经有4人回复
-
求调剂推荐 材料 304
已经有4人回复
18楼2015-01-13 10:53:08
huangguiyang
新虫 (小有名气)
- 1ST强帖: 1
- 应助: 4 (幼儿园)
- 金币: 176.1
- 红花: 1
- 帖子: 84
- 在线: 12.9小时
- 虫号: 483011
- 注册: 2007-12-26
stefsui2楼2012-07-03 02:47:55
huangguiyang
新虫 (小有名气)
- 1ST强帖: 1
- 应助: 4 (幼儿园)
- 金币: 176.1
- 红花: 1
- 帖子: 84
- 在线: 12.9小时
- 虫号: 483011
- 注册: 2007-12-26
3楼2012-07-03 02:52:03
huangguiyang
新虫 (小有名气)
- 1ST强帖: 1
- 应助: 4 (幼儿园)
- 金币: 176.1
- 红花: 1
- 帖子: 84
- 在线: 12.9小时
- 虫号: 483011
- 注册: 2007-12-26
4楼2012-07-03 02:58:27
