24小时热门版块排行榜    

查看: 3295  |  回复: 10
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

zhongshun

至尊木虫 (著名写手)

[求助] 求助关于solvate的一些疑惑

请问怎么判断溶解蛋白的水球是否足够大,我一直使用vmd的wat_sphere.tcl脚本将蛋白溶解于水溶液中,vmd 中看到的蛋白质肽链的末段好像有一部分在水球的外面。。。。。。。
有没有什么方法可以稍微增大水球的大小呀?求指点
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

我学习计算的一些帖子

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhongshun

至尊木虫 (著名写手)

好吧,自己再看看吧
7楼2012-07-02 18:14:16
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 11 个回答

jiaoyixiong

荣誉版主 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
zh1987hs: 金币+2, 谢谢 2012-07-01 17:46:25
你所说的水球是什么意思?

是溶液的形状是球状的吗?

那你把球状的半径增大一些不就可以了吗?
2楼2012-07-01 16:47:22
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhongshun

至尊木虫 (著名写手)

溶液的形状是球状的,但是怎么在wat_sphere.tcl脚本中增加水球的半径呢,是改变哪个参数呀?希望版主能具体指导
3楼2012-07-01 21:57:25
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jiaoyixiong

荣誉版主 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★
chaizhm: 金币+2, 谢谢~ 2012-07-02 09:15:50
引用回帖:
3楼: Originally posted by zhongshun at 2012-07-01 21:57:25
溶液的形状是球状的,但是怎么在wat_sphere.tcl脚本中增加水球的半径呢,是改变哪个参数呀?希望版主能具体指导

你需要把 wat_sphere.tcl 中的每个命令看明白,你就知道怎么修改了。

PS
我这里没有你所说的这个脚本,无法得知
4楼2012-07-01 23:45:27
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 看板上这么多中的,有点像50人群里49个人都是骗子的那种感觉…… +3 a089 2026-08-26 4/200 2026-08-27 08:25 by ZJTJZ
[基金申请] 让我中一个面上吧! +13 大萍1987 2026-08-20 17/850 2026-08-27 08:20 by 大萍1987
[基金申请] 基金不中,共勉 +6 eulota 2026-08-26 6/300 2026-08-27 08:00 by zzuzxg
[基金申请] 国自然面上复盘~欢迎讨论 +7 晴天加油 2026-08-26 8/400 2026-08-27 07:53 by longfie172
[基金申请] 我不理解! +15 Edward_pc 2026-08-26 23/1150 2026-08-26 20:34 by zzuzxg
[基金申请] 出来了 +9 trojank 2026-08-26 9/450 2026-08-26 14:25 by 宝贝虫子
[基金申请] 哪位高人中了,把查询到的截图贴出来让我看看,让我长长见识 +4 yuleib84 2026-08-26 5/250 2026-08-26 13:40 by yuleib84
[基金申请] 为什么国自然不能直接公布 +4 bjdxyxy 2026-08-26 4/200 2026-08-26 13:12 by qingmu1201
[基金申请] 科研孤儿太难了 +21 我4大白菜 2026-08-20 22/1100 2026-08-26 11:29 by nlgza
[基金申请] 国际合作可查了,中了面上 +18 Ldrop2023 2026-08-26 18/900 2026-08-26 11:15 by cmrandy
[基金申请] 系统进不去 +4 yanglien 2026-08-26 5/250 2026-08-26 11:10 by wenfengw83
[基金申请] 怎么看青基中了没有啊 +4 叶九微 2026-08-26 4/200 2026-08-26 10:52 by xiacongxu
[基金申请] 国合可查了 +3 paperzjh 2026-08-26 3/150 2026-08-26 10:41 by LemmonTr
[基金申请] 在坚冰还盖着北海的时候,我看到了怒放的梅花。 (金币+10) +6 ziyangfang 2026-08-25 9/450 2026-08-25 20:26 by huagongfeihu
[基金申请] 今日不放榜?网传国自然预计 8 月 27 日可查结果 +17 医学老男孩 2026-08-20 22/1100 2026-08-25 15:36 by 医学老男孩
[基金申请] 如果此刻你正在为国基感到焦虑,不妨来听听这首《基金之外》 +8 scalable 2026-08-24 8/400 2026-08-25 12:52 by jnhyjjm
[教师之家] 跳槽后在研项目怎么办? +5 简单化xn 2026-08-22 10/500 2026-08-23 12:38 by 简单化xn
[基金申请] 时间戳今天,20号变了 +5 archvillain 2026-08-20 5/250 2026-08-22 06:12 by hui_daxiao
[基金申请] 看来今天不会放榜了? +8 chengyan1220 2026-08-21 11/550 2026-08-21 17:52 by dcqxinyang
[基金申请] 基金啊基金 +4 longfie172 2026-08-20 4/200 2026-08-21 08:58 by mark mao
信息提示
请填处理意见