应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » Gromacs/Amber/NAMD » 求助关于solvate的一些疑惑
51/1返回列表
查看: 2834  |  回复: 10
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

zhongshun

至尊木虫 (著名写手)

[求助] 求助关于solvate的一些疑惑

请问怎么判断溶解蛋白的水球是否足够大，我一直使用vmd的wat_sphere.tcl脚本将蛋白溶解于水溶液中，vmd 中看到的蛋白质肽链的末段好像有一部分在水球的外面。。。。。。。
有没有什么方法可以稍微增大水球的大小呀？求指点
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

我学习计算的一些帖子

» 本帖已获得的红花（最新10朵）

Mars_kang

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2012-07-01 16:39:05
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

Mars_kang

禁虫
送红花一朵
本帖内容被屏蔽
10楼2023-03-23 15:02:48
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 11 个回答

jiaoyixiong

荣誉版主 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
zh1987hs: 金币+2, 谢谢 2012-07-01 17:46:25
你所说的水球是什么意思？

是溶液的形状是球状的吗？

那你把球状的半径增大一些不就可以了吗？
赞一下 回复此楼
2楼2012-07-01 16:47:22
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhongshun

至尊木虫 (著名写手)
溶液的形状是球状的，但是怎么在wat_sphere.tcl脚本中增加水球的半径呢，是改变哪个参数呀？希望版主能具体指导
赞一下 回复此楼
3楼2012-07-01 21:57:25
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jiaoyixiong

荣誉版主 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★
chaizhm: 金币+2, 谢谢~ 2012-07-02 09:15:50
引用回帖:
3楼: Originally posted by zhongshun at 2012-07-01 21:57:25
溶液的形状是球状的，但是怎么在wat_sphere.tcl脚本中增加水球的半径呢，是改变哪个参数呀？希望版主能具体指导

你需要把 wat_sphere.tcl 中的每个命令看明白，你就知道怎么修改了。

PS
我这里没有你所说的这个脚本，无法得知
赞一下 回复此楼
4楼2012-07-01 23:45:27
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 11 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭