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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Vasp&MedeA » vasp结构优化中EDIFF以及KPOINTS设置，以及氢吸附结合能问题！
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mousekingadv

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
leisy: 金币+8 2012-06-19 20:43:50
xueht987: 金币+1, 应助指数+1, 多谢指教！ 2012-06-20 08:32:19
leisy: 金币+4 2012-07-21 20:22:42
引用回帖:
10楼: Originally posted by leisy at 2012-06-19 16:31:06
谢谢指导！。那POTIM去什么样的值会越精确，计算花费的时间会随着精度的增大而增大吗？...

For IBRION=1,2 or 3, POTIM serves as a scaling constant for the forces.也就是下一离子步时离子的位置是这一步的位置+search vector*POTIM。所以当初始结构较坏时离子每步可以大一些（即较大的POTIM）。只要最后收敛了，POTIM、ALGO、IBRION都与结果的精度无关。
个人理解接近收敛之后由于MAXMIX的存在，1E-04到1E-06的时间会小于1E+00收敛到1E-02的时间。
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11楼2012-06-19 17:59:19
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leisy

银虫 (初入文坛)
引用回帖:
11楼: Originally posted by mousekingadv at 2012-06-19 17:59:19
For IBRION=1,2 or 3, POTIM serves as a scaling constant for the forces.也就是下一离子步时离子的位置是这一步的位置+search vector*POTIM。所以当初始结构较坏时离子每步可以大一些（即较大的POTIM）。只要最 ...

好的，谢谢。
我在优化的时候好像两次隔开的优化，后一次不能利用前一次已生成的WAVECAR（用ISTART=1）时，好像只有在一次优化中包含几个数据点优化时，（比如，一个三维结构，改变其某个方向长度相当于压缩或者拉伸的）这样好像前一个数据点生成的wavecar才能被后面的数据点利用。两次隔开的我不会用。要怎么设置才可以，结构该怎样拷过去。

还有那个vasp中说All the calculations were performed using the discrete Flourier transform 【DFT】 method, as implemented in Vienna ab initio simulation package  【VASP】，这个是什么意思，VASP不是基于密度泛函，只有us-pp和paw吗？那个离散傅里叶变换（上面DFT）究竟应该是在什么位置，起什么作用？谢谢！
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12楼2012-06-19 20:43:12
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mousekingadv

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★
xueht987: 金币+1, 多谢指教！ 2012-06-20 08:32:36
引用回帖:
12楼: Originally posted by leisy at 2012-06-19 20:43:12
好的，谢谢。
我在优化的时候好像两次隔开的优化，后一次不能利用前一次已生成的WAVECAR（用ISTART=1）时，好像只有在一次优化中包含几个数据点优化时，（比如，一个三维结构，改变其某个方向长度相当于压缩或者拉 ...

不需要更改目录，把INCAR、KPOINTS改一下，cp CONTCAR POSCAR再跑一遍就行了。至于WAVECAR的读取，我的个人经验是即使不同体系算出来的WAVECAR都能互相读取，但这没有意义（读取并非当前体系的近收敛WAVECAR，和random初值一样了）

没听说过discrete Flourier transform，听名字像是KPOINT mesh里面用到的东西...DFT通常说的是density function theory
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13楼2012-06-19 21:32:34
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leisy

银虫 (初入文坛)
请问有关在硅纳米线上加氧该怎样加，有什么软件可以用来自动加氧，因为手动的话怕加的不合键的存在方式。有相关论文提出加氧的方法吗，有的话还请仁兄义姐给出几篇（论文标题和作者就成就行）。Masterial Studio在加氧这一块是怎样加的？谢谢！
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14楼2012-06-26 10:03:52
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fyuewen

金虫 (正式写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by fanchen021 at 2012-06-19 08:52:37
1. EDIFF 精度提高了，的确可能减少离子步数，但会增加每个离子步的时间，所以要选择要适中，一般1e-4~1e-6就可以。可以自己找一个体系测试一下。
2. 应该用后一种方法。所有结构都要优化。

EDIFF是和电子步相关的，EDIFFG才是和离子步相关的。
EDIFF精度提高了怎么还和离子步时间有关呢？
这个不太对吧？
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Physicsloveukulele!Aloha!
15楼2012-07-23 19:55:38
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fyuewen

金虫 (正式写手)
引用回帖:
9楼: Originally posted by mousekingadv at 2012-06-19 15:38:34
1.离子步的个数与EDIFF有关，因为电子步越精确，每个离子受力计算的越准确。但这个计算精确的提高并不如良好的POTIM值来的明显（其实POTIM有点运气成分）。通常粗优化时调低EDIFF，POTIM取0.75-1.25（个人经验），I ...

EDIFF精度提高，是否可能会让离子步的步数增加？
我觉得这个可能会的。因为电子步的计算都伴随了离子步的计算，而每一步离子计算都会得到准确的费曼-海尔曼力，只有当EDIFF手链标准达到的时候，离子步的计算才可能提前结束。

这一理解对否？
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Physicsloveukulele!Aloha!
16楼2012-07-23 20:00:25
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tsglss

铁杆木虫 (著名写手)
请问怎么搭建摸纳米线？
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做好自己
17楼2013-05-28 18:21:00
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刘小伟110

木虫 (小有名气)
楼主好，请问你是怎么计算单个H原子的能量呢，还有就是，我如果计算OH的能量，该怎么做呢。。。
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慢慢的思考。。。
18楼2014-02-26 09:47:35
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