24小时热门版块排行榜

返回列表

当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

schalke

至尊木虫 (著名写手)

应助: 10 (幼儿园)
金币: 19986.9
红花: 25
帖子: 2012
在线: 315.5小时
虫号: 1524251
注册: 2011-12-05
专业: 生物化学

[求助] 各位师兄师姐请进，为什么找完过渡态后IRC跑出来的峰顶部有问题？

模拟过渡态后，只有一个虚频，振动方向也对，但是IRC跑出的峰顶是平的，很奇怪，是什么原因？怎么改才是正确的？

输入文件如下：
%mem=8GB
%nprocshared=6
%chk=20120612_Dimer_acid_ts_freq_simplized.chk
#p irc=(maxpoints=10,rcfc) b3lyp/6-31+g(d,p) maxdisk=40GB

20120612_Dimer_acid_ts_irc_simplized

0 1
C                0.40233500 3.21378000 1.96150600
H                1.27882900 3.86279900 2.07424400
H                -0.32329700 3.76141800 1.32885100
C                2.08893900 -0.31068100 -0.77122100
H                2.16849500 -0.60881300 -1.82569300
C                3.23509200 -0.97147600 0.01411800
H                3.17320900 -0.66520900 1.06593000
H                3.09715400 -2.06200100 0.00465800
C                4.62235200 -0.62845200 -0.54533100
H                4.76005700 0.46287800 -0.53014900
H                4.67482500 -0.92696400 -1.60287300
C                5.77270100 -1.29211400 0.22351000
H                5.71759400 -0.99927900 1.28216000
H                5.63982200 -2.38379200 0.20308900
C                7.16299200 -0.94348000 -0.32422400
H                7.29699800 0.14706400 -0.30113500
H                7.21798800 -1.23434100 -1.38263800
C                8.30514200 -1.61338100 0.44852300
H                8.29797200 -1.31457700 1.50359000
H                9.28234900 -1.34373400 0.03316900
H                8.21913400 -2.70607000 0.41444000
C                0.73921800 1.91133000 1.32206100
H                2.22621400 0.77479000 -0.75792400
C                0.25690300 0.69658700 1.77251800
C                0.70238900 -0.71931100 -0.26267300
C                0.27353600 -0.52056000 1.07644100
H                -0.06597500 3.07807400 2.94245300
C                -0.54391900 1.73160400 -1.10104200
C                -0.49407100 0.35047800 -1.44024500
C                -1.78674100 -0.46014200 -1.63761200
H                -1.54374700 -1.32679100 -2.26625500
H                -2.46943600 0.15655000 -2.23969700
C                -2.56147300 -0.97643100 -0.41167900
H                -2.65381600 -0.19110600 0.34823600
H                -1.99929300 -1.78831300 0.06378900
C                -3.95763400 -1.49547500 -0.78372400
H                -3.86376700 -2.25497000 -1.57423400
H                -4.54650800 -0.67563900 -1.22031200
C                -4.72514200 -2.09487100 0.40204300
H                -4.81499000 -1.33914400 1.19636200
H                -4.13957400 -2.92012100 0.83325200
C                -6.12371800 -2.60882400 0.03527700
H                -6.03428700 -3.36110300 -0.76087100
H                -6.71169700 -1.78380700 -0.39045800
C                -6.87941300 -3.21312200 1.22443600
H                -7.87188700 -3.57056800 0.92886200
H                -7.01619200 -2.47484700 2.02368300
H                -6.33280400 -4.06310300 1.65015800
C                -1.70533700 2.44913300 -0.65386200
H                -2.56681600 1.86380600 -0.33504700
C                -1.82616900 3.80196000 -0.62268100
H                -0.98652000 4.40960000 -0.96381000
C                -3.07050300 4.54248200 -0.22484700
H                -3.47401200 5.12732800 -1.06329900
H                -2.87823800 5.25724000 0.58635200
H                -3.85424200 3.85553800 0.11160600
H                1.47452100 1.94070000 0.53045900
H                -0.32104500 0.71418300 2.69794200
H                -0.31814600 -1.31824700 1.51877200
H                0.46032600 -1.72375600 -0.62145300
H                0.19027900 0.18268200 -2.27161900
H                0.28564700 2.34742700 -1.44234600

回复此楼

» 猜你喜欢

ELISA试验中不容忽视的细节盘点(二) 已经有0人回复
汕头大学化学招调剂，相关内容如下。已经有4人回复
物理化学论文润色/翻译怎么收费? 已经有300人回复
华南师范大学广州市光谱分析与功能探针重点实验室诚招青年英才和博士后岗位研究人员已经有11人回复
华南师范大学广州市光谱分析与功能探针重点实验室诚招青年英才和博士后岗位研究人员已经有10人回复
细胞培养，这22个细节一定要注意！（一）已经有0人回复
CSC访学博后项目获批，外方学校暂停合作该怎么办？已经有51人回复
求标准卡片Cu0.4In0.4Zn1.2S2 PDF#32-0340 已经有2人回复
量子点电致发光器件（QLED）：蓝光量子点（QDs）和纳米氧化锌电子传输材料已经有0人回复
需要一个圆偏振光诱导化学反应，请问使用圆偏振光作为光源，应该需要哪些设备搭建已经有0人回复

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:

1楼2012-06-14 20:04:02

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

meteoric30

木虫 (正式写手)

应助: 43 (小学生)
金币: 1719.5
散金: 12
红花: 2
帖子: 436
在线: 320.7小时
虫号: 1046846
注册: 2010-06-24
性别: GG
专业: 催化化学

引用回帖:

4楼: Originally posted by schalke at 2012-06-15 09:39:25
过渡态已经优化完毕，而且过渡态结构对应的是top2个点的中间位置，但并没有在IRC中显示出过渡态的点，但计算结果中含有过渡态结构。。。我是先算出过渡态的频率，然后读取其chk文件做irc，是否和读取chk文件有关？...

2点的能量和过渡态的能量也不一样吗？我意思还是再优化下ts 再freq