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Discover中Ewald summation和Dynamics times设定的问题
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在Discover的设定中可以同时设定vdW & Coulomb的summation method 为 Ewald，但是审稿人提出了疑问：How could one use Ewald summation to deal with van der Waals interaction? 这个该怎么回答？ 另外由200个小分子组成的体系，设定Dynamics times为2 ns是否足够，该如何证明？ |
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5楼2012-06-13 15:59:19
chaizhm
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2楼2012-06-13 13:36:49
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谢谢！ 但是在MS的Discover模块和Forcite模块中vdW的summation method都可以设定为Ewald；且附件中的这篇文献第3页有一句描述。 分子模拟最后的结果已经符合预期的设想，但是审稿人觉得必须要增加时间，也不知道该加到多少才符合  |
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3楼2012-06-13 15:11:14
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4楼2012-06-13 15:45:10