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xiongxiong5712

新虫 (小有名气)

[求助] 如何把siesta中的分数坐标导入MS中

用siesta优化完结构,想导入MS中进行掺杂,不知道该怎样做。
下面是我的结构信息,麻烦高手帮忙看看,多谢了:
outcoor: Relaxed atomic coordinates (fractional):           
    0.33098559    0.50979355    0.24999999   2       1  N
    0.58344239    0.49661979    0.25000000   2       2  N
    0.49208398    0.32093981    0.25000000   2       3  N
    0.49622497    0.58894228    0.24999999   2       4  N
    0.43475946    0.43120905    0.25000000   2       5  N
    0.68077655    0.67261808    0.25000001   2       6  N
    0.41655897    0.50338195    0.75000000   2       7  N
    0.66901329    0.49020203    0.74999999   2       8  N
    0.50377560    0.41105821    0.75000001   2       9  N
    0.50791638    0.67905990    0.75000000   2      10  N
    0.31922298    0.32737913    0.74999999   2      11  N
    0.56524198    0.56879314    0.75000000   2      12  N
    0.34002442    0.42026160    0.24999999   2      13  N
    0.58368716    0.40848682    0.24999999   2      14  N
    0.58400131    0.66367028    0.24999999   2      15  N
    0.41599909    0.33632984    0.74999999   2      16  N
    0.41631292    0.59151098    0.74999999   2      17  N
    0.65997693    0.57973863    0.75000000   2      18  N
    0.28359326    0.42420731    0.25000000   1      19  Si
    0.54253592    0.43059426    0.25000000   1      20  Si
    0.53009247    0.66622062    0.24999999   1      21  Si
    0.30259413    0.35157627    0.24999999   1      22  Si
    0.56099758    0.33773741    0.25000000   1      23  Si
    0.56046514    0.59869448    0.24999998   1      24  Si
    0.39900120    0.46247048    0.24999999   1      25  Si
    0.63859983    0.46616008    0.24999998   1      26  Si
    0.65247865    0.71231164    0.25000000   1      27  Si
    0.46990737    0.33378199    0.75000000   1      28  Si
    0.45746238    0.56940833    0.74999999   1      29  Si
    0.71640729    0.57579197    0.75000000   1      30  Si
    0.43953539    0.40130610    0.75000000   1      31  Si
    0.43899990    0.66226155    0.74999999   1      32  Si
    0.69740711    0.64842310    0.75000000   1      33  Si
    0.34752258    0.28768783    0.74999999   1      34  Si
    0.36140024    0.53383712    0.74999998   1      35  Si
    0.60100141    0.53753054    0.75000000   1      36  Si

outcell: Unit cell vectors (Ang):
       27.515364  -15.130166    0.000000
       -0.017127   30.230667    0.000000
        0.000000    0.000000    2.894188

outcell: Cell vector modules (Ang)   :   31.400910   30.230672    2.894188
outcell: Cell angles (23,13,12) (deg):     90.0000     90.0000    118.8380
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xhzha

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
xiongxiong5712: 金币+3, 谢谢,我试试 2012-06-15 14:57:34
siesta做输入文件时,可以加一条Write CoorXmol     T  这条命令,就可以输出.xyz文件,可以直接导入MS
3楼2012-06-14 17:25:54
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love5264

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
liliangfang: 金币+1, 谢谢交流 2012-06-12 22:08:55
你研究一下ms的输入文件(有的隐藏),比如castep的,提供个思路
(个人用Dmol3的)
谋定而动
2楼2012-06-12 19:20:30
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