24小时热门版块排行榜    

查看: 3739  |  回复: 14
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

六世之爱

铜虫 (小有名气)

[求助] 卟啉(100—150个原子)高斯计算的计算机配置问题

组里一直做卟啉合成,模拟部分一直委托外面的做,现在老师想自己做,但又没有人懂。所以小弟只能上来问问各位战友的意见。我们做卟啉的计算主要是做构型优化,计算下LUMO,HOMO,计算方法一般就是DFT,将来也可能引入TDDFT运算。卟啉大小一般是100-150个原子,其中碳原子50到70个吧,剩下的基本都是H原子。由于我们合成系列化合物比较多,一个系列大概10个左右,最好一周之内算完。像这种情况应该配置一个什么样的计算机呢?预算大概多少钱?另外,我们学校有一个超算中心,开户免费,现在还处于测试阶段,没有机时费。一个月后开始收机时费,价格未定。不知道这两个选择怎么样选择比较适合我们组的情况。谢谢大家了!
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

六世之爱

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
9楼: Originally posted by yjcmwgk at 2012-06-05 15:59:49
你该去问问他们,有没有对称性控制以降低计算量?有没有用RI或其他什么近似方法来加速计算……等等...

那要是申请一百多个CPU得算上两三天,按照中科院0.2一CPU时的收费岂不是一个分子就得一千多块钱啊
10楼2012-06-05 16:44:37
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 15 个回答

鱼妃

金虫 (著名写手)

挖坑不填

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
六世之爱: 金币+10, ★★★很有帮助 2012-06-05 11:54:44
每个体系上百原子
一共十个体系
要求一周内算完?!
我勒个去~
己所不欲,勿施于人;己所欲者,亦勿施人。无论穷达,但守本分;八风不动,独善自身。
2楼2012-06-05 11:47:26
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

六世之爱

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 鱼妃 at 2012-06-05 11:47:26
每个体系上百原子
一共十个体系
要求一周内算完?!
我勒个去~

小弟什么都不懂啊,刚接触,组里也没有师兄师姐做这个的。那你估计得多长时间呢?还有自己买计算机和用超算中心的应该怎么选择呢,太感谢了
3楼2012-06-05 11:54:37
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

gujing136

禁虫 (文坛精英)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
gmy1990: 金币+1 2012-06-05 14:37:43
六世之爱: 金币+10, ★★★很有帮助 2012-06-05 15:02:35
我们组有人做卟啉,优化,四台机器并行,每台机器双核,1G内存,DFT方法,6-311G(d,p),两到三天。
叫老猫的兔子
4楼2012-06-05 14:11:13
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 中青基了要发朋友圈吗? +7 349506619 2026-08-28 7/350 2026-08-31 13:39 by 冼亮淀粉酶
[基金申请] 国社科又开始会评了,不知道这次命运如何 +6 雨打竹帘 2026-08-30 10/500 2026-08-31 09:29 by huixian257
[基金申请] 能否申诉? +6 echo8914667 2026-08-30 7/350 2026-08-31 08:41 by kingkocxr
[基金申请] 面上意见出来了 +10 黄鸟于飞Chao 2026-08-29 19/950 2026-08-31 08:01 by blueearth171
[基金申请] 为什么到现在没收到通知? +5 tannykie 2026-08-29 5/250 2026-08-30 21:05 by purplejack
[基金申请] 有没有仍没收到信息的 +7 德尚中行 2026-08-27 8/400 2026-08-30 20:52 by purplejack
[基金申请] 麻烦专家们看看评委们的意见(F口面上) +6 gdd2018 2026-08-28 11/550 2026-08-30 08:58 by 超级无敌华子
[基金申请] 国自然评审意见 +13 wangmingqi 2026-08-28 19/950 2026-08-29 10:22 by Poppy1104
[基金申请] 2026年叶企孙基金 +4 bud_bud 2026-08-27 7/350 2026-08-29 07:23 by foolishmani
[基金申请] 为什么资助数各大高校都创新高,自己申请怎么就这么难 +12 Kittylucky 2026-08-27 13/650 2026-08-29 00:04 by superceng
[基金申请] 基金系统什么内容也没有 30+4 winsaint 2026-08-27 9/450 2026-08-28 11:06 by maolC
[基金申请] 怎么查啊 +6 huang1991js 2026-08-26 6/300 2026-08-28 08:42 by winsaint
[基金申请] 基金未中,这种答复是模板吗? +5 zhaosm1982 2026-08-27 6/300 2026-08-27 16:00 by lfy8008
[基金申请] 看板上这么多中的,有点像50人群里49个人都是骗子的那种感觉…… +5 a089 2026-08-26 6/300 2026-08-27 14:05 by jonewore
[基金申请] 怎么看青基中了没有啊 +5 叶九微 2026-08-26 5/250 2026-08-27 10:35 by l_zh2008
[基金申请] 国合里面能看到了 +7 一怀馨秋 2026-08-26 7/350 2026-08-26 11:23 by zhaosm1982
[基金申请] 系统进不去 +4 yanglien 2026-08-26 5/250 2026-08-26 11:10 by wenfengw83
[基金申请] 项目信息和经费信息在系统里都可以看到了 +6 wittyboy 2026-08-26 14/700 2026-08-26 10:55 by wittyboy
[基金申请] 今天务委会开完了,明天出结果吗 +19 angus9576 2026-08-25 23/1150 2026-08-26 10:03 by zp519
[基金申请] 牛来!米来!面来! +8 beefly 2026-08-26 8/400 2026-08-26 08:37 by xuzhipiao
信息提示
请填处理意见