应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

Znn3bq.jpeg
小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » LAMMPS/DL_POLY » VMD怎么看
汕头大学海洋科学接受调剂
51/1返回列表
查看: 1375  |  回复: 6
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

水影恋镜

新虫 (小有名气)

[求助] VMD怎么看

大家好，我在模仿做金属的空位缺陷时，已经生成XYZ文件，放入VMD中，怎么看金属原子的缺少啊？求大侠帮助。。。
回复此楼

» 本帖附件资源列表

  • 欢迎监督和反馈：小木虫仅提供交流平台，不对该内容负责。
    本内容由用户自主发布，如果其内容涉及到知识产权问题，其责任在于用户本人，如对版权有异议，请联系邮箱：xiaomuchong@tal.com
  • 附件 1 : project2.pdf
    • 2012-05-23 15:36:50, 1.12 M

» 猜你喜欢
1楼 2012-05-23 15:36:53
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

我爱罗_沙

新虫 (小有名气)
引用回帖:
5楼: Originally posted by jiaoyixiong at 2012-05-24 08:44:03
请仔细阅读VMD手册 Using the atomselect command 一章内容，
不管你的想看什么位置，都可以选择显示，都可以看得清楚

的确用atomselect可以只显示特定性质的原子（比如说配位数），但是空位是没有原子的地方，没有原子请问如何显示？
赞一下 回复此楼
Aal izz well。。。
7楼2013-02-17 14:18:14
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 7 个回答

zhangliang8

木虫 (正式写手)

木虫之友

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
zh1987hs: 金币+2, 谢谢 2012-05-23 21:12:11
根据输入文件可以估算一下你去掉的原子在哪个区域内，在VMD中通过坐标显示出那个区域（即空位所在那一层原子面），就能很清楚的看到空位缺陷。
赞一下 回复此楼
2楼2012-05-23 20:21:43
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

水影恋镜

新虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by zhangliang8 at 2012-05-23 20:21:43:
根据输入文件可以估算一下你去掉的原子在哪个区域内，在VMD中通过坐标显示出那个区域（即空位所在那一层原子面），就能很清楚的看到空位缺陷。

这个方法不是太好，就这个例子而言吧，空位缺陷位于中心位置，完全看不出，你还有什么好方法么？
赞一下 回复此楼
3楼2012-05-23 21:55:09
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

水影恋镜

新虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by zhangliang8 at 2012-05-23 20:21:43:
根据输入文件可以估算一下你去掉的原子在哪个区域内，在VMD中通过坐标显示出那个区域（即空位所在那一层原子面），就能很清楚的看到空位缺陷。

这个方法就本例的话，看的不是很清楚，主要是空位缺陷位于中心位置，你还有好的方法么?求指教。。。
赞一下 回复此楼
4楼2012-05-23 21:56:29
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 7 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 271求调剂 +29 2261744733 2026-04-11 29/1450 2026-04-14 16:48 by zhouxiaoyu
[考研] 调剂 +12 月@163.com 2026-04-11 12/600 2026-04-14 15:37 by zs92450
[考研] B区0809 ，数一英一，290 求调剂 +3 泠潍1111 2026-04-12 4/200 2026-04-13 20:35 by 学员JpLReM
[考研] 一志愿华工085600 331分 +7 天下ww 2026-04-09 7/350 2026-04-13 09:01 by lhj2009
[考研] 求调剂288 +7 ioodiiij 2026-04-10 9/450 2026-04-13 08:33 by Hayaay
[考研] 。 +10 李多米lee. 2026-04-12 11/550 2026-04-12 22:58 by yuyin1233
[考研] 一志愿西北工业大学289 085602 +33 yang婷 2026-04-10 34/1700 2026-04-12 08:11 by Art1977
[考研] 一志愿厦大0856，306求调剂 +15 Bblinging 2026-04-11 15/750 2026-04-11 22:53 by 314126402
[考研] 267求调剂 +8 再忙也要吃饭啊 2026-04-09 8/400 2026-04-11 21:42 by cfdbai
[考研] 求调剂 +6 电气300求调剂不 2026-04-08 6/300 2026-04-11 20:14 by 逆水乘风
[考研] 求调剂 +11 翩翩一书生 2026-04-09 11/550 2026-04-11 19:57 by 逆水乘风
[考研] 296求调剂 +6 汪！？！ 2026-04-09 6/300 2026-04-11 11:25 by zhq0425
[考研] 化学工程与技术324调剂 +23 孙常华 2026-04-09 25/1250 2026-04-11 00:07 by 骑牛渡寒江
[考研] 调剂 +12 卷卷卷心菜_ 2026-04-09 13/650 2026-04-10 22:36 by Ftglcn90
[考研] 287求调剂 +15 Fnhc 2026-04-07 21/1050 2026-04-10 19:09 by chemisry
[考研] 一志愿京区985，085401，与本科专业一致，电子信息工程， +4 阳光开朗的男孩 2026-04-10 4/200 2026-04-10 18:27 by shenrf
[考研] 初试261 +3 Asht少 2026-04-10 6/300 2026-04-10 16:38 by Asht少
[考研] 085501机械英二77总分294求调剂，接受跨专业学习 +6 守法公民亓纪 2026-04-08 6/300 2026-04-09 15:55 by wp06
[考研] 334求调剂 +16 Riot2025 2026-04-08 17/850 2026-04-09 09:28 by wdyheheeh
[考研] 软件工程求调剂22软工296分求调剂，接受跨调 +4 yangchen2017 2026-04-08 5/250 2026-04-08 21:56 by 土木硕士招生
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭