应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » LAMMPS/DL_POLY » VMD怎么看
51/1返回列表
查看: 1499  |  回复: 6
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

水影恋镜

新虫 (小有名气)

[求助] VMD怎么看

大家好，我在模仿做金属的空位缺陷时，已经生成XYZ文件，放入VMD中，怎么看金属原子的缺少啊？求大侠帮助。。。
回复此楼

» 本帖附件资源列表

  • 欢迎监督和反馈：小木虫仅提供交流平台，不对该内容负责。
    本内容由用户自主发布，如果其内容涉及到知识产权问题，其责任在于用户本人，如对版权有异议，请联系邮箱：xiaomuchong@tal.com
  • 附件 1 : project2.pdf
    • 2012-05-23 15:36:50, 1.12 M

» 猜你喜欢
1楼 2012-05-23 15:36:53
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

我爱罗_沙

新虫 (小有名气)
引用回帖:
5楼: Originally posted by jiaoyixiong at 2012-05-24 08:44:03
请仔细阅读VMD手册 Using the atomselect command 一章内容，
不管你的想看什么位置，都可以选择显示，都可以看得清楚

的确用atomselect可以只显示特定性质的原子（比如说配位数），但是空位是没有原子的地方，没有原子请问如何显示？
赞一下 回复此楼
Aal izz well。。。
7楼2013-02-17 14:18:14
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 7 个回答

zhangliang8

木虫 (正式写手)

木虫之友

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
zh1987hs: 金币+2, 谢谢 2012-05-23 21:12:11
根据输入文件可以估算一下你去掉的原子在哪个区域内，在VMD中通过坐标显示出那个区域（即空位所在那一层原子面），就能很清楚的看到空位缺陷。
赞一下 回复此楼
2楼2012-05-23 20:21:43
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

水影恋镜

新虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by zhangliang8 at 2012-05-23 20:21:43:
根据输入文件可以估算一下你去掉的原子在哪个区域内，在VMD中通过坐标显示出那个区域（即空位所在那一层原子面），就能很清楚的看到空位缺陷。

这个方法不是太好，就这个例子而言吧，空位缺陷位于中心位置，完全看不出，你还有什么好方法么？
赞一下 回复此楼
3楼2012-05-23 21:55:09
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

水影恋镜

新虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by zhangliang8 at 2012-05-23 20:21:43:
根据输入文件可以估算一下你去掉的原子在哪个区域内，在VMD中通过坐标显示出那个区域（即空位所在那一层原子面），就能很清楚的看到空位缺陷。

这个方法就本例的话，看的不是很清楚，主要是空位缺陷位于中心位置，你还有好的方法么?求指教。。。
赞一下 回复此楼
4楼2012-05-23 21:56:29
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 7 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 投票:  有多少人是今天查系统知道结果的？ +17 爱看书的可乐 2026-08-26 19/950 2026-09-02 00:19 by xiangy672
[基金申请] 面上合作单位盖章 +6 ssyjh 2026-08-27 9/450 2026-09-01 20:01 by huagongfeihu
[基金申请] 面上函评意见出来了，像什么等级？ 20+4 Tsingking1 2026-08-27 17/850 2026-09-01 19:51 by 超级无敌华子
[基金申请] 基金未中，这种答复是模板吗？ +6 zhaosm1982 2026-08-27 7/350 2026-08-31 21:18 by qdxxmc
[基金申请] 哪位高人中了，把查询到的截图贴出来让我看看，让我长长见识 +6 yuleib84 2026-08-26 7/350 2026-08-31 19:46 by 鱼翔浅底1
[基金申请] 面上意见出来了 +12 黄鸟于飞Chao 2026-08-29 23/1150 2026-08-31 18:57 by 黄鸟于飞Chao
[基金申请] 能否申诉？ +7 echo8914667 2026-08-30 8/400 2026-08-31 17:00 by yihongxu
[基金申请] 中青基了要发朋友圈吗？ +7 349506619 2026-08-28 7/350 2026-08-31 13:39 by 冼亮淀粉酶
[基金申请] 基金不中，共勉 +12 eulota 2026-08-26 12/600 2026-08-31 08:42 by ZJTJZ
[考博] 找导师 +6 yuanjiabao 2026-08-29 7/350 2026-08-30 14:40 by 生科新手
[基金申请] 2026年叶企孙基金 +4 bud_bud 2026-08-27 7/350 2026-08-29 07:23 by foolishmani
[基金申请] 系统查不到 +11 董八千 2026-08-26 11/550 2026-08-28 18:06 by Leogzhya
[基金申请] 基金系统什么内容也没有 30+4 winsaint 2026-08-27 9/450 2026-08-28 11:06 by maolC
[基金申请] 怎么查啊 +6 huang1991js 2026-08-26 6/300 2026-08-28 08:42 by winsaint
[基金申请] 我不理解！ +15 Edward_pc 2026-08-26 23/1150 2026-08-26 20:34 by zzuzxg
[基金申请] 国合里面能看到了 +7 一怀馨秋 2026-08-26 7/350 2026-08-26 11:23 by zhaosm1982
[基金申请] 国际合作可查了，中了面上 (EPI+1)(金币+50) +18 Ldrop2023 2026-08-26 18/900 2026-08-26 11:15 by cmrandy
[基金申请] 项目信息和经费信息在系统里都可以看到了 +6 wittyboy 2026-08-26 14/700 2026-08-26 10:55 by wittyboy
[基金申请] 国合可查了 +3 paperzjh 2026-08-26 3/150 2026-08-26 10:41 by LemmonTr
[基金申请] 牛来！米来！面来！ +8 beefly 2026-08-26 8/400 2026-08-26 08:37 by xuzhipiao
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭