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汕头大学海洋科学接受调剂
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水影恋镜

新虫 (小有名气)

[求助] VMD怎么看

大家好,我在模仿做金属的空位缺陷时,已经生成XYZ文件,放入VMD中,怎么看金属原子的缺少啊?求大侠帮助。。。
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  • 2012-05-23 15:36:50, 1.12 M

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水影恋镜

新虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by zhangliang8 at 2012-05-23 20:21:43:
根据输入文件可以估算一下你去掉的原子在哪个区域内,在VMD中通过坐标显示出那个区域(即空位所在那一层原子面),就能很清楚的看到空位缺陷。

这个方法就本例的话,看的不是很清楚,主要是空位缺陷位于中心位置,你还有好的方法么?求指教。。。
4楼2012-05-23 21:56:29
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zhangliang8

木虫 (正式写手)

木虫之友

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
zh1987hs: 金币+2, 谢谢 2012-05-23 21:12:11
根据输入文件可以估算一下你去掉的原子在哪个区域内,在VMD中通过坐标显示出那个区域(即空位所在那一层原子面),就能很清楚的看到空位缺陷。
2楼2012-05-23 20:21:43
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水影恋镜

新虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by zhangliang8 at 2012-05-23 20:21:43:
根据输入文件可以估算一下你去掉的原子在哪个区域内,在VMD中通过坐标显示出那个区域(即空位所在那一层原子面),就能很清楚的看到空位缺陷。

这个方法不是太好,就这个例子而言吧,空位缺陷位于中心位置,完全看不出,你还有什么好方法么?
3楼2012-05-23 21:55:09
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jiaoyixiong

荣誉版主 (职业作家)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
chaizhm: 金币+1, 谢谢~ 2012-05-24 09:19:25
请仔细阅读VMD手册 Using the atomselect command 一章内容,
不管你的想看什么位置,都可以选择显示,都可以看得清楚
5楼2012-05-24 08:44:03
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