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mche2005

木虫 (正式写手)

7-5-3

[求助] 在用CTAB法提取曲霉总DNA时,提取很多次没有成功,期望大家多多帮助。

1、PDA培养适当时间(72h),真菌菌丝体9000转离心3min,滤纸吸水。吸除绝大部分水分,否则,含水量过大会严重影响液氮研磨的效率。
或者直接用灭菌的八折纱布进行过滤。
2、研钵(液氮研磨)至粉末。快速研磨,严防液氮溅射。研磨过程中防止样品因为液氮挥发所导致的冻融。
3、加入预热的CTAB700uL,轻柔的颠倒混匀,65℃水浴1h(每隔10min摇一次),室温12000rpm,10min,吸取上清。
4、加入等体积的氯仿:异戊醇(24:1),12000rpm,5min,取上清(500uL)。
5、加入等体积的氯仿:异戊醇(24:1),12000rpm,5min,4℃离心后,取上清液(500uL)。
6、加入-20℃预先冷存异丙醇(2/3体积),-20℃冰箱沉淀1h。12000rpm,10min,4℃离心后取上清。
7、75%乙醇洗涤2次,12000rpm,3min,4℃离心。
8、室温晾干10-15min,加入20-50uL TE溶解。
9、加入RNase A (10 mg/mL) ,37℃保温30 min 以上。
10、取 4u L 电泳。加入1uL Rnase 37摄氏度消化30min,电泳检测结果


结果,提了很多次都没有成功,请问是什么原因?
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霸_霸

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
试剂盒吧 霉菌dna手提不容易 试剂盒很便宜的
12楼2012-05-24 14:13:25
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cxfans

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
小丹木木: 金币+2, 鼓励交流 2012-05-23 14:06:33
离心怎么是常温呢?4度离心的。异丙醇沉淀时候我们是等体积。ctab是2%的吧,试一下3%的,再加一些pvp 1%和 巯基乙醇 1%,我就是这样提真菌的dna 很好用。第二次抽提 用氯仿。
2楼2012-05-23 11:32:52
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香菱儿

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
mche2005: 金币+2, ★★★很有帮助, 感谢您的帮助 2012-05-23 12:25:23
液氮研磨时研磨得充分一些,CTAB裂解时间再加长一些试试。
漫洒英雄泪,相离处士家。谢慈悲剃度在莲台下。没缘法转眼分离乍。赤条条来去无牵挂。那里讨烟蓑雨笠卷单行?一任俺芒鞋破钵随缘化!
3楼2012-05-23 11:56:35
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植物园园长

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
用试剂盒不更好,方便又好用,
在路上~~Marketing!
4楼2012-05-23 16:37:40
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