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上善若水-川

金虫 (小有名气)

[求助] gromacs中如何使用Buckingham势能参数

哪位童鞋在gromacs中用过Buckingham势能的形式?文献给出了Buckingham势能的参数,可是gromacs中的势能参数皆默认采用的LJ形式的,不懂怎么弄,难道要把Buckingham函数形式拟合成LJ函数形式求得LJ参数?这样误差会不会太大啊?求指点!!!谢谢哈~~~
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最低奋斗目标:农夫,山泉,有点田~~~
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金虫 (小有名气)

引用回帖:
9楼: Originally posted by 上善若水-川 at 2012-05-16 08:26:42:
哦哦,不过混用的话感觉好奇怪啊,Buckingham是ABC,LJ是sigma与epsilon,怎么用混合规则啊?!

我也不知道呐。。。
10楼2012-05-16 08:30:57
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jiaoyixiong

荣誉版主 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
jiaoyixiong: 回帖置顶 2012-05-14 09:39:11
chaizhm: 金币+2, 谢谢~ 2012-05-14 10:38:09
请阅读手册(我看的是4.5.4版本)
124页和129页内容
你一看便知


» 本帖已获得的红花(最新10朵)

2楼2012-05-14 09:37:01
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上善若水-川

金虫 (小有名气)

送鲜花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by jiaoyixiong at 2012-05-14 09:37:01:
请阅读手册(我看的是4.5.4版本)
124页和129页内容
你一看便知

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可是Buckingham里面的参数形式都是有三个的,而gromacs力场里面添加的只有sigma和epsilon,没有Buckingham里面的A,B,C,那这三个参数添加到哪里啊?跪求指点~


最低奋斗目标:农夫,山泉,有点田~~~
3楼2012-05-14 21:28:09
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jiaoyixiong

荣誉版主 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★
上善若水-川: 金币+2, ★★★很有帮助 2012-05-14 21:52:56
引用回帖:
3楼: Originally posted by 上善若水-川 at 2012-05-14 21:28:09:
可是Buckingham里面的参数形式都是有三个的,而gromacs力场里面添加的只有sigma和epsilon,没有Buckingham里面的A,B,C,那这三个参数添加到哪里啊?跪求指点~
a8/0a/1411646_1337002071_244.jpg



请仔细看手册内容,
还得自己多多体会

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

4楼2012-05-14 21:42:23
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