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hraikeyan

金虫 (小有名气)


[交流] 酰胺酶的筛选方法

各位大侠,最近我要构建一个酰胺酶的筛选方法。基因组文库都比较好建立,就是没有一个高效有效的筛选方法,不知有没有谁做过这方面的研究,能否指点一二。
ps:底物为内酰胺,被酶水解后变为氨基酸
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gjs713

至尊木虫 (职业作家)


★ ★ ★
小丹木木: 金币+3, 鼓励交流 2012-09-13 14:18:05
引用回帖:
5楼: Originally posted by hraikeyan at 2012-05-15 14:20:21
用茚三酮显色法我们考虑过,具体是在一个文献上看到的,将构建的基因文库转化涂平板,在用沾有底物的滤纸沾平板上的菌落,使其反应一段时间后再用该滤纸沾用茚三酮湿润的滤纸,但结果是所有的印迹都显色。分析原因 ...

不好意思,可能之前因为帖子太多的缘故漏掉了你这个回复。
最近在看文献的过程中看到这么一篇Appl Microbiol Biotechnol 的文章
来自于上海华东理工的许建和团队
He Y-C, Ma C-L, Xu J-H, Zhou L (2011) A high-throughput screening strategy for nitrile-hydrolyzing enzymes based on ferric hydroxamate spectrophotometry. Appl Microbiol Biotechnol 89: 817-823.
介绍了一种高通量筛选的较为灵敏 可以排除较多干扰的方法。。你稍微看看是否有参考价值?
另外,建议你可以多查查羧酸特异的颜色反应,这方面文献貌似更多一些,可行性估计也更高。做的人多。
7楼2012-09-12 22:09:50
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huangju0305

新虫 (初入文坛)


★ ★ ★
hraikeyan(金币+1): 谢谢参与
小丹木木: 金币+2, 鼓励交流 2012-05-14 13:45:45
你的问题有点模糊,你想通过测定酶活来筛选这个酰胺酶吗?如果是的话,那么可以从底物的变化和生成的氨基酸来检测酶活。前提是底物是有特定紫外吸光值,或将生成的氨基酸衍生化进行荧光检测。一点拙见,还望各位大侠指教。
2楼2012-05-14 09:22:25
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shenlin0514

木虫 (正式写手)


★ ★ ★
hraikeyan(金币+1): 谢谢参与
小丹木木: 金币+2, 鼓励交流 2012-05-14 13:45:55
你可以做一个酶偶联筛选方案,即你的目的酶蛋白将内酰胺水解后生成特定的氨基酸后,再使用该氨基酸特异性催化酶进行反应,生成某种能够产生显色反应或是能与NADH等指示试剂产生反应,就可以进行筛选。
不过筛选方法最重要的稳定性和重复性,即对于同一个蛋白质使用该筛选方法需使CV小于等于10%,否则没有意义。
3楼2012-05-14 10:33:34
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gjs713

至尊木虫 (职业作家)



hraikeyan(金币+1): 谢谢参与
有一个较为常规的方法不知道楼主是否考虑过,采用茚三酮反应来进行筛选,大规模初筛可以通过纸层析或在96孔板上进行。。
4楼2012-05-14 22:50:03
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