24小时热门版块排行榜    

查看: 2596  |  回复: 13
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

livein合肥

铁杆木虫 (正式写手)

[求助] 系统发育树求教,不知道自己做的这个树有没有什么问题

因论文需要,自己制作了一个自筛真菌的系统发育树,请各位大虾看看有没有什么问题。源序列是不是太少了,我只在NCBI网站上找到了大约10个序列,筛选后用了其中的3个。

系统发育树
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

土壤真菌

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

stone2239

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
livein合肥: 金币+2 2012-05-17 20:58:31
引用回帖:
5楼: Originally posted by livein合肥 at 2012-05-16 20:33:46:
stone哥,在NCBI网站的数据库上我只找到了大约4种100%同源序列,其他的序列很多都是克隆菌种,所以没有用。可以用吗?

1.建树选用的序列不需要100%同源,功能上相关即可
2.可以加几个被孢霉科其他属的序列,要是没有,就用被孢霉属的种吧
6楼2012-05-17 13:21:32
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 14 个回答

shuiliuyang

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
我现在也建系统发育树,想请教你从NCBI比对后的10个序列是怎么筛选成3个的?按照什么依据筛选的?
2楼2012-05-13 18:23:09
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

livein合肥

铁杆木虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by shuiliuyang at 2012-05-13 18:23:09:
我现在也建系统发育树,想请教你从NCBI比对后的10个序列是怎么筛选成3个的?按照什么依据筛选的?

我也是随便做的,不知道对不对呢。所以,想请教各位虫友大虾呢。
3楼2012-05-13 18:42:35
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

stone2239

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
livein合肥: 金币+3, ★★★很有帮助 2012-05-16 20:37:40
为什么不把你查到的十个序列一起建树呢?
我觉得你选的序列太少
不过你的结果已经可以说明几个种之间的亲缘关系啦
4楼2012-05-16 18:43:01
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 0703化学调剂,求各位老师收留 +7 秋有木北 2026-03-14 7/350 2026-03-15 17:30 by 小物理化学
[考研] 290求调剂 +4 @将就将就看 2026-03-10 8/400 2026-03-14 14:23 by 千千运气
[考研] 理学化学调剂 +3 040517FYfy? 2026-03-09 3/150 2026-03-14 03:09 by JourneyLucky
[考研] 333求调剂 +3 球球古力 2026-03-09 3/150 2026-03-14 01:57 by JourneyLucky
[考研] 265求调剂 +9 小木虫085600 2026-03-09 12/600 2026-03-14 01:11 by JourneyLucky
[考研] 材料工程,326分,求调剂 +6 KRSLSR 2026-03-10 6/300 2026-03-13 23:47 by JourneyLucky
[考研] 279求调剂 +3 Dizzy123@ 2026-03-10 3/150 2026-03-13 23:02 by JourneyLucky
[考研] 337一志愿华南理工0805材料求调剂 +7 mysdl 2026-03-11 9/450 2026-03-13 22:43 by JourneyLucky
[考研] 泣血叩求调剂恩,愿以丹心报师恩 +6 Iuruoh 2026-03-11 6/300 2026-03-13 22:06 by JourneyLucky
[考研] 材料工程调剂 +9 咪咪空空 2026-03-12 9/450 2026-03-13 22:05 by 星空星月
[考研] 290求调剂 +9 ADT 2026-03-11 9/450 2026-03-13 21:55 by JourneyLucky
[考研] 304求调剂 +7 7712b 2026-03-13 7/350 2026-03-13 21:42 by peike
[考研] 0703化学一志愿211 总分320求调剂 +5 玛卡巴卡啊哈 2026-03-11 5/250 2026-03-13 21:40 by JourneyLucky
[硕博家园] 深圳大学硕士招生(2026秋,传感器方向,仅录取第一志愿) +4 xujiaoszu 2026-03-11 7/350 2026-03-13 17:28 by xujiaoszu
[考研] 308求调剂 +3 是Lupa啊 2026-03-12 3/150 2026-03-13 14:30 by 求调剂zz
[考研] 0703一志愿211 285分求调剂 +4 ly3471z 2026-03-13 4/200 2026-03-13 13:00 by JourneyLucky
[考研] 一志愿河海大学085900土木水利专硕279求调剂不挑专业 +4 SunWwWwWw 2026-03-10 8/400 2026-03-13 02:23 by SunWwWwWw
[考研] 083000环境科学与工程调剂 +8 mingmingry 2026-03-09 9/450 2026-03-11 10:23 by 沙漠之狐994
[考博] 26申博求助 +3 跳跃饼干 2026-03-10 4/200 2026-03-10 21:15 by Tntcnn
[考研] 0856材料与化工353分求调剂 +11 NIFFFfff 2026-03-09 11/550 2026-03-10 18:36 by suyuanhai
信息提示
请填处理意见