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hucuiyao

新虫 (小有名气)

[交流] 菌液PCR问题 已有10人参与

我做菌液PCR,同学说出来的都是引物二聚体,这是怎么回事呢?
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yichongweiban
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zoeye

金虫 (小有名气)

★ ★ ★
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小丹木木: 金币+2, 鼓励交流 2012-05-11 13:45:29
如果都是引物二聚体 就证明没有你的目的条带咯?
你是多少体系PCR 菌液加了多少 菌液浓度大概多少 是摇过夜的菌还是什么?
一般菌液PCR容易出假阳性的结果
初步筛选是可以的 然后在把阳性结果抽个质粒PP看最好
11楼2012-05-11 10:53:17
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xzx018

铁杆木虫 (著名写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
上图啊,引物二聚体都在最下面,我的都在100bp以下,在做菌液pcr时先把菌煮沸5min左右,使细胞裂解,当然也有人说预变性时也可以达到这个目的
2楼2012-05-09 15:06:12
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137167741

至尊木虫 (著名写手)

★ ★
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西瓜: 金币+1, 鼓励交流 2012-05-09 19:11:41
要说明你为什么做菌液PCR,如果单纯是细菌基因组有该基因,即存在模板,PCR出来都是引物二具体,说明有可能引物不行,有可能是PCR操作有问题;若是连接载体,转化感受态细胞,检验是否有目的基因,可能是由于你转化失败,质粒没有转进去。
总有一天我要修改用户名。
4楼2012-05-09 16:23:06
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超然渡陈

金虫 (小有名气)

★ ★ ★ ★
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西瓜: 金币+3, 鼓励交流 2012-05-09 19:11:47
楼主应该是用菌液PCR做快速鉴定转化后的阳性克隆吧?所用的引物是你之前克隆基因的引物,还是载体上的通用引物?要把具体情况说清楚而且最好要带图的。假如用的是克隆基因时的引物,做菌落PCR或者菌液PCR没有目的条带而出现引物二聚体可以大概说明是假阳性。要是用的通用引物或者其它新的引物,可能是你退火温度没选好或者其它一些原因,但是不能肯定是假阳性。另外需要说明的是做酵母菌落或者菌液PCR要提前煮沸,因为酵母有细胞壁,预变性和变性不能使壁完全破碎,而一般的细菌就不用预先煮沸。
5楼2012-05-09 17:10:37
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