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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 急！基因用PRIMER5翻译出来为什么和密码子不符？
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loveskyzhou

铁虫 (正式写手)

[求助] 急！基因用PRIMER5翻译出来为什么和密码子不符？

有段测序后的基因，其中有处是CTG，按密码子应该是D才对。但用PRIMER5整段翻译出来后却把他翻译成了E，这是为什么呢？而且查了文献，那个位置确实是E，弄不明白了啊。。。。我把软件的截图也放上好了，有问题的是蛋白的第71个氨基酸。  麻烦给仔细讲讲啊
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我会绕一个圈，走回到实验室
1楼2012-05-08 12:56:51
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cheng_xiao

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
西瓜: 金币+3, Good！辛苦哈~ 2012-05-08 17:57:51
你的东西我仔细看过了，CTG处是第70个碱基，而不是71个，所以你把我坑苦了，你软件翻译的没错，CTG密码用RNA的密码就是CUG（你的软件就是这样翻译过来的）所以编码Leu氨酸，而不是D氨酸。也许你说应该是上述密码的互补密码，CTG就翻译成GAC，GAC确实编码D氨基酸，但你的软件翻译时没有把密码互补后翻译，不信你可以仔细看一下，实验顺利啊
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loveskyzhou
我努力我奋斗我成功
2楼2012-05-08 16:44:15
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loveskyzhou

铁虫 (正式写手)
送鲜花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by cheng_xiao at 2012-05-08 16:44:15:
你的东西我仔细看过了，CTG处是第70个碱基，而不是71个，所以你把我坑苦了，你软件翻译的没错，CTG密码用RNA的密码就是CUG（你的软件就是这样翻译过来的）所以编码Leu氨酸，而不是D氨酸。也许你说应该是上述密码的 ...

非常感谢啊，但我有点糊涂了。我这个基因是测序得到的，也比对过，可按你的说法这段链应该是和mRNA相同的那条链吗？或者说是3-5顺序的链？
我自己觉得它应该是5-3的啊，之后翻译成mRNA，所以密码子应该反过来才对啊。。。。。。晕啦
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我会绕一个圈，走回到实验室
3楼2012-05-09 12:10:48
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cheng_xiao

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
西瓜: 金币+2, 鼓励交流 2012-05-09 19:01:26
loveskyzhou: 金币+5, ★★★★★最佳答案, 我再看看，我一直以为自己这里很明白的，想做突变，结果看着看着糊涂了，谢谢啦 2012-05-09 22:54:33
是这样的，你把基因的正义连，反义链，编码链，非编码链搞混了，在《分子生物学》Robert F. Weaver 著，郑用琏， 张富春， 徐启江等译的第三章有详细的介绍，你可以看一下。在一个就是tRNA的反密码子与密码子配对关系，还有DNA是双链的，这里边不是一两句话说清楚的，你可以仔细看一下书，实验顺利啊
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我努力我奋斗我成功
4楼2012-05-09 15:35:03
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137167741

至尊木虫 (著名写手)
这个不是多重要的东西，序列对就行了。
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总有一天我要修改用户名。
5楼2012-05-09 16:26:33
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