24小时热门版块排行榜    

CyRhmU.jpeg
查看: 2188  |  回复: 10
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

dq20081935

铜虫 (小有名气)

[求助] MS discover dynanic报错

大家给分析下这是怎样引起的,怎样处理?
ERROR Error: Dynamics: Energy difference between successive steps in dynamics is greater than the user defined variable DEVIATION, 5000.000


其设置如下:Begin Forcefield Section
  begin forcefield = compass
#
# Nonbond section:
  forcefield nonbond \
      -separate_coulomb \
    vdw \
    summation_method = atom_based \
      cutoff = 9.50 \
      spline_width = 1.00 \
      buffer_width = 0.50 \
    coulomb \
    dielectric_value = 1.0000
#
# vdW long range energy correction
  vdWTailCorrection 9.50
# End Forcefield Section
#
# Dynamics Section:
  dynamics \
    time = 5000.00 \
    timestep = 1.00 \
    initial_temperature = 1498.00 \
    ensemble = NPT \
    temperature_control_method = andersen \
    collision_ratio = 1.00 \
    temperature = 1498.00 \
    press_choice = pressure \
    pressure = 0.10000 \
    pressure_control_method = berendsen_pc \
    press_decay_constant = 0.10 \
    deviation = 5000.00 \
    execute frequency = 500.00 \
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

分子模拟

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

mirror27

木虫 (正式写手)

引用回帖:
10楼: Originally posted by dq20081935 at 2012-05-09 11:32:55
谢谢你的回复,问题已经解决了,刚开始建模的错,我设了一个并不了解的空间群(196F)导致添加的铁原子是二价态的,从而报出Warning: Energy:   The simulation box is not neutral.
谢谢你的帮助,让我了解了更多 ...

跟空间群有关吗?请问你是怎样建的模呀?不是直接输入的吗?再切下表面建个真空层?
11楼2012-09-26 20:44:08
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 dq20081935 的主题更新
信息提示
请填处理意见