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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 存档旧帖 » ACE index and chao index
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学术骗子小刚

银虫 (小有名气)

[求助] ACE index and chao index 已有2人参与

各位，请问一下ACE 、chao  index分别代表什么意思   如图所示。谢谢了
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加油加油
1楼 2012-04-30 22:42:48
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atlanticwi

金虫 (正式写手)

琴美喜欢发呆 不喜欢发脾气

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
西瓜: 金币+1, 鼓励交流 2012-05-01 01:20:38
嗯....................
       这个有点意思呢，我看到Shannon咯，这个是生态方向的文章吗？如果是的我猜这个是样方统计表吧，Shannon指的香农指数？Coverage指覆盖度吗？推荐维基一下，很全的
       纯属我的无责任推测 若有说错请高手一定纠正哦
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Let God do with it as He wills
2楼2012-04-30 23:43:38
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学术骗子小刚

银虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by atlanticwi at 2012-04-30 23:43:38:
嗯....................
       这个有点意思呢，我看到Shannon咯，这个是生态方向的文章吗？如果是的我猜这个是样方统计表吧，Shannon指的香农指数？Coverage指覆盖度吗？推荐维基一下，很全的
       纯属我的 ...

是的，生态多样性的文章  那几个指标啥意思不太明白
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加油加油
3楼2012-05-01 00:32:01
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学术骗子小刚

银虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by atlanticwi at 2012-04-30 23:43:38:
嗯....................
       这个有点意思呢，我看到Shannon咯，这个是生态方向的文章吗？如果是的我猜这个是样方统计表吧，Shannon指的香农指数？Coverage指覆盖度吗？推荐维基一下，很全的
       纯属我的 ...

维基上面也没说明白阿
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加油加油
4楼2012-05-01 00:33:22
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天鸟

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
学术骗子小刚: 金币+1, ★有帮助 2012-05-01 10:27:39
这个用mothur软件就可以全部实现你的那些指数，置于那几个指数都是关于微生物群落的多样性的了，就是不同的算法而已，需要再学习
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学术骗子小刚
快乐生活，我快乐
5楼2012-05-01 09:49:28
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学术骗子小刚

银虫 (小有名气)
送鲜花一朵
引用回帖:
5楼: Originally posted by 天鸟 at 2012-05-01 09:49:28:
这个用mothur软件就可以全部实现你的那些指数，置于那几个指数都是关于微生物群落的多样性的了，就是不同的算法而已，需要再学习

请问哪个可以找到一些相关的资料 您方面发一份给我吗？
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加油加油
6楼2012-05-01 10:28:29
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天鸟

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

http://www.mothur.org/wiki/Main_Page
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学术骗子小刚
快乐生活，我快乐
7楼2012-05-01 10:50:41
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学术骗子小刚

银虫 (小有名气)
送鲜花一朵
引用回帖:
7楼: Originally posted by 天鸟 at 2012-05-01 10:50:41:
http://www.mothur.org/wiki/Main_Page

您好，我是想知道chao  ACE  coverage具体怎么理解  像我帖的那个图一样  那些数据  是越大说明多样性越高吗？您有资料解释这两个数据吗   可以加QQ不  我的382408162
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加油加油
8楼2012-05-01 11:37:39
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zmyhello

新虫 (初入文坛)
你好，我想问一下，coverage是怎么算出来的？是用mothur吗做的吗？怎么做的呢，我用的qiime，没有给出coverage。
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9楼2013-06-18 13:37:49
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小木屋121

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

亲 你做的应该是高通量测序 chao与ace比值代表了群落丰富度的高低 比值越高 丰富度越高
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10楼2015-03-23 17:06:21
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