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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Vasp&MedeA » Ubuntu 12.04 下 FFTW 安装
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qlm2008

金虫 (小有名气)

[交流] Ubuntu 12.04 下 FFTW 安装 已有3人参与

1. 下载软件

2. 解压软件 tar -xzvf 软件包名字＋扩展名
3.  分别使用三个命令
    ＃./configure
    ＃make
    ＃make install

完成
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1楼 2012-04-30 12:17:12
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iamikaruk

木虫 (著名写手)
★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
fzx2008: 金币+2, 谢谢指教 2012-04-30 15:08:07
可以aptitude install fftw
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[img]http://osu.ppy.sh/stat2/iamikaruk-0.png[/img]
2楼2012-04-30 15:00:23
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dxf_dxf_dxf

银虫 (小有名气)
★ ★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
fzx2008: 金币+3, 谢谢指教 2012-05-03 18:45:04
引用回帖:
2楼: Originally posted by iamikaruk at 2012-04-30 15:00:23:
可以aptitude install fftw

使用apt-get安装可能有诸多不便：
   需要root权限，而你在实际进行计算工作时你需要在集群上完成，那时你没有root权限。
   不能手动指定编译器，例如编译vasp时需要用到intel编译器，这时推荐也用相同版本的intel编译器编译fftw
   所安装的fftw很可能不是最新版本的软件，可能存在诸多bug。
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3楼2012-05-03 18:40:51
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iamikaruk

木虫 (著名写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
3楼: Originally posted by dxf_dxf_dxf at 2012-05-03 18:40:51:
使用apt-get安装可能有诸多不便：
   需要root权限，而你在实际进行计算工作时你需要在集群上完成，那时你没有root权限。
   不能手动指定编译器，例如编译vasp时需要用到intel编译器，这时推荐也用相同版本的 ...

如果是集群的话不提倡自己编译，常见的数学库一般都是由提供集群的人将编译环境和编译环境测试优化好之后提供的，自己编译在效率上比不上。
最新不一定就是最好，在消除旧bug的时候可能在另外一个地方埋下新bug，相对来说我更信赖debian的stable打包者。
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4楼2012-05-03 21:34:14
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souledge

专家顾问 (著名写手)
★ ★ ★
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fzx2008: 金币+2, 专家考核, 谢谢回帖！ 2012-05-04 00:10:11
引用回帖:
3楼: Originally posted by dxf_dxf_dxf at 2012-05-03 18:40:51:
使用apt-get安装可能有诸多不便：
   需要root权限，而你在实际进行计算工作时你需要在集群上完成，那时你没有root权限。
   不能手动指定编译器，例如编译vasp时需要用到intel编译器，这时推荐也用相同版本的 ...

编译VASP不一定要用到intel编译器。比如在AMD平台上，ifort的效率比PathScale慢到1/4~1/3之间。而且，FFTW3也不一定是最快的选择，在intel平台上用intel自带的fftw3xf，在AMD平台上用ACML都是很有效率的选择。
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思想重于技巧，内涵重于表象
5楼2012-05-03 22:12:03
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dxf_dxf_dxf

银虫 (小有名气)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
5楼: Originally posted by souledge at 2012-05-03 22:12:03:
编译VASP不一定要用到intel编译器。比如在AMD平台上，ifort的效率比PathScale慢到1/4~1/3之间。而且，FFTW3也不一定是最快的选择，在intel平台上用intel自带的fftw3xf，在AMD平台上用ACML都是很有效率的选择。

PathScale是什么？
我们的集群是Intel的
intel自带的fftw3xf快一些么？有测试过么？
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6楼2012-05-04 14:08:35
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