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乐石||

木虫 (正式写手)

应助: 26 (小学生)
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专业: 半导体材料

[求助] CASTEP跑分子动力学已有1人参与

请教各位，我在用CASTEP跑MD的时候，经过20ps发现结构没有太大的变化，这样可以说明其稳定性吗？
另外，虽然整体结构没变，但单胞中的所有原子在做整体的位移，怎样消除这种位移呢？
还有，文献中有的给出了能量-时间或键长-时间、原子-时间的图，这样的图对说明稳定性来说很有必要吗？在CASTEP中该如何作这种图？
谢谢大家~

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1楼 2012-04-29 16:03:36

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

anlen0615

银虫 (小有名气)

应助: 8 (幼儿园)
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性别: GG
专业: 电路与系统

MS中CASTEP去做分子动力学计算过程中出现如下问题：
linux超算平台计算时，直到计算完都没有提示任何报错和警告　但在 .castep 文件中的数据只写到七八十步  下面就没有了！　只是在最后的std_err.txt文件中给出了如下的提示：
MPI Application rank 8 exited before MPI_Finalize() with status 0 ！
不知道是什么原因！
我在计算中设置了NPT 300K 0.0001Gpa 0.2fs  2000steps
nose 外在压力设置了三个方向各为  0.0001Gpa  ！
请问LZ在计算过程中可出现过这样的问题？是设置的问题么？

  希望大神给予指导！
鄙人金币不多  但必不吝啬！