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liumangtu403

铁虫 (小有名气)

[求助] 关于5‘RACE已有1人参与

各位高手:
         本人最近用clontech 做5'RACE,经过克隆测序确定是我要的序列,并且系列两端找到了相应的引物序列,同时也找到了接头序列。但是这个片段比网上的公布的序列要短(该序列目前仅有RNA ID,没有基因名),我想请问,是否连上接头的就一定是全长?如何确定扩出片段是全长?  盼回复!谢谢!
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liumangtu403

铁虫 (小有名气)

引用回帖:
13楼: Originally posted by 脱水拂空 at 2012-04-27 14:39:49:
你可以将得到的序列 再重新设计全长引物重新扩一下 然后再重新分析ORF部分就知道是不是全长啦

用全长引物扩不是只能证明片段有这么长,但不能证明片段不只是这么长....不知道我理解的有没有误

另外我的片段是non-coding RNA,原则上应该没有ORF或只有短的ORF......
14楼2012-04-27 17:57:53
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liumangtu403

铁虫 (小有名气)

自己顶一下,各位高手请不吝赐教!
2楼2012-04-25 22:13:29
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XOooZzz

银虫 (小有名气)


西瓜: 金币+1, 鼓励交流 2012-04-26 22:03:26
用的是smart吧?个人感觉smart容易在连续几个G的位点加上接头.....反正我做是失败了
3楼2012-04-25 22:51:10
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liumangtu403

铁虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by XOooZzz at 2012-04-25 22:51:10:
用的是smart吧?个人感觉smart容易在连续几个G的位点加上接头.....反正我做是失败了

我的序列扩出的最5‘没有连续的几个G,但下游10bp处有几个连续的G,有影响吗?

另外问一下,怎么知道是失败了(就是你怎么知道扩出的不是全长)?
4楼2012-04-26 12:50:47
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