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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 我在跑胶时的DNA片段大小为什么与测序后的相差很大呢？？？求大侠指导！
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三吉草

铜虫 (小有名气)

[求助] 我在跑胶时的DNA片段大小为什么与测序后的相差很大呢？？？求大侠指导！

我在做一种真菌rDNA-ITS序列的测定，跑胶时DNA片段大小大概有600bp以上，可测序之后仅有523bp，不知是什么原因差别如此大？求原因！！！！
注：跑胶时胶板有些浮起来的现象，别的无异常。测序用的ITS1和ITS4双向测序！
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1楼 2012-04-22 12:58:00
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jingdejun

铁杆木虫 (小有名气)
该说的，他们都已经说了。

那我就纯冒泡吧。
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9楼2012-04-23 21:49:29
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atlanticwi

金虫 (正式写手)

琴美喜欢发呆 不喜欢发脾气

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
西瓜: 金币+2, 鼓励应助！ 2012-04-22 19:11:04
三吉草: 金币+2, 嘿嘿，同样谢谢你呢 2012-04-23 15:18:28
嗯.................
虽然没有做过你这个，但觉得很正常哦，跑胶分子量不对但测序正常的事情太常见了哦，测序是最终也是最可靠地手段哦，跑胶说明不了什么问题滴...............
个人看法，若有说错请高手指点哦
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Let God do with it as He wills
2楼2012-04-22 13:07:56
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freerain

禁虫 (职业作家)
★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
三吉草: 金币+5, ★有帮助, 谢谢你！ 2012-04-23 15:17:46
本帖内容被屏蔽
4楼2012-04-22 14:42:08
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三吉草

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by freerain at 2012-04-22 14:42:08:
跑胶时DNA片段大小是估测值，应该以测序为准
测序结果中能读到引物序列就没有问题了

哦，我总以为应该差别不太大，差了100bp呢，我想应该分析一下原因，毕竟跟我一起做的同学，她的跑胶结果和测序的结果很接近啊，郁闷！！！
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5楼2012-04-22 17:01:52
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