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xiazhiwuxie

银虫 (小有名气)


[交流] 预测三级结构

通过一个基因,通过生物信息学方法,推导得到一段氨基酸序列,想看看其3D结构,但是SWISS-MODEL 弄不出结果,
- Start BLAST for highly similar template structure identification
- No suitable templates found!
- Run HHSearch to detect remotely related template structures
- Unfortunately, we could not identify useful template structures
用来其他预测三维结构的软件,也预测不出,想问下各位,该怎么办?
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木虫 (著名写手)


★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
xiazhiwuxie: 金币+2 2012-04-26 08:46:57
我觉得你可以在数据库中先寻找下同源蛋白,然后再预测结果,
7楼2012-04-24 08:36:43
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查看全部 7 个回答

ynkuaile

木虫 (小有名气)



小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
这一段氨基酸序列在生物体中确实存在吗?有同源蛋白存在吗?
2楼2012-04-22 21:22:50
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sunwei57

木虫 (小有名气)



小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
没有同原蛋白的结构作为参考,软件是预测不出高级结构的
3楼2012-04-22 22:03:04
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xiazhiwuxie

银虫 (小有名气)


引用回帖:
2楼: Originally posted by ynkuaile at 2012-04-22 21:22:50:
这一段氨基酸序列在生物体中确实存在吗?有同源蛋白存在吗?

没有同源蛋白结构
4楼2012-04-23 12:29:59
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