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mizhoulong

木虫 (著名写手)

环境卫生、微生物学

[求助] 通用引物需要自己设计吗?

最近关注16s rDNA的测序问题,因为以前没做过,看引物需要通用引物,这个通用引物是固定序列的吗?用的引物多为 8F/1492R 或者27F/1492R ,看了很多文献,但是这个引物序列却不完全一样,如,1942R,有用5'-GGY TAC CTT GTT ACG ACT T-3’的,还有用5'TAC GGC TAC CTT GTT AGG ACT T3'的。这个引物需要自己设计还是随便找一种?

以前做的PCR实验,多用参考文献,或者自己从pubmed上下载序列用primer设计引物。

所以请问各位虫友们,通用引物序列是不变的吗?还是需要自己设计引物?
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环境卫生、微生物学、卫生应急
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gjs713

至尊木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

★
感谢参与,应助指数 +1
mizhoulong: 金币+1, ★★★很有帮助 2012-04-19 09:30:49
16s rDNA通用引物 我们这边做的比较多,都是用P0-P6,序列一搜网上就有的,效果很好。推荐楼主试一下。
勤奋、执着、专注,则无坚不破。
4楼2012-04-18 23:28:51
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charon1982

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
直接发给引物合成公司合成就行了
帮助虫友,提升自己
2楼2012-04-18 11:57:15
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vir2008

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
测序么,一般不需要自己设计引物的。
要是效果不佳,负责任的公司都会重新尝试其他方案,所以不必担心了。
3楼2012-04-18 17:41:34
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kiruwa

专家顾问 (职业作家)

【答案】应助回帖

★
感谢参与,应助指数 +1
mizhoulong: 金币+1, ★★★很有帮助, 我也打算用27F/1492R 2012-04-19 09:30:35
不需要自己设计,我们实验室一直用27F/1492R,效果很好. 你把序列告诉公司,他们会帮你合成的.
请注意,照片不是我本人!!!请不要把此人和我的长相联系到一起去.
5楼2012-04-18 23:53:08
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