24小时热门版块排行榜    

查看: 1104  |  回复: 5

wpgo

新虫 (初入文坛)

[求助] scan文件中想要一个原子向另一个原子运动,怎么设置

Title Card Required

0 1
Si            
Si                 1    3.15879818
Si                 2    3.10797028    1  138.67849769
O                  2    1.59276629    1   11.61338336    3   54.02516532    0 H
O                  2    1.63187928    1  120.43538293    4  -51.23813396    0 H
O                  1    1.60090032    4  108.95259772    2  157.47624445    0 H
Si                 6    1.64247334    1  135.21108082    4  -58.38179073    0 H
Si                 3    2.99994609    2  138.58513801    1   29.90711125    0 H
O                  3    1.56555724    2  120.30571385    1   30.20886178    0 H
Si                 7    5.51486046    6  107.23920721    1  141.47547894    0 H
Si                10    3.14939239    7  103.47414989    6 -100.51064084    0 H
Si                11    3.13982231   10  136.83944773    7   77.54930368    0 H
O                 11    1.58355374   10   11.66312461    7   26.18082915    0 H
O                 12    1.61648869   11   14.30802637   10    3.03637798    0 H
O                 10    1.59642861    7   16.53132092    6   79.96831067    0 H
Si                12    4.45323298   11  167.45925400   10 -121.35340354    0 H
Si                15    1.64029728   10  135.01236007    7   51.88271922    0 H
Si                16    4.56548742   12   68.53460472   11  148.43003252    0 H
Al                 8    2.99438591    3  134.01284467    2   39.63206847    0 H
O                 18    1.60454284   16   62.32397645   12  -43.68190532    0 H
O                 16    1.56652657   12   50.56548195   11  109.90044995    0 H
O                 12    1.69577060   11  107.88079595   10  -30.86177774    0 H
O                  8    1.59974215    3  110.02727265    2   42.71899167    0 H
O                  7    1.60197559    6  101.21883960    1  131.50696233    0 H
C                 22    2.57250810   12  139.83268028   11   37.99920772    0 H
C                 25    1.52423952   22   34.97298062   12  -66.11698379    0 H
C                 26    1.51174116   25  117.54187733   22 -125.58147491    0 H
O                 25    1.41132532   22   93.97493245   12   56.92939383    0 H
H                 25    1.09716111   22  138.88102613   12  -67.34584995    0 H
H                 25    1.09267295   22   94.81545093   12  170.05344248    0 H
H                 26    1.07943620   25  105.05935802   22  109.77118276    0 H
H                 27    1.09469540   26  107.17132634   25  -55.47714611    0 H
H                 27    1.09456939   26  110.95401758   25 -173.62018708    0 H
H                 27    1.08867097   26  111.37663202   25   63.72724446    0 H
H                 28    0.97219369   25  104.91914644   22   55.67631572    0 H
O                  6        3.00231212         1   85.02344109    4   54.91924734    0 H
H                 36    0.96618377    6   34.68567850    1 -172.08841255    0 H
H                 36    0.96693711    6   82.03379820    1  -41.26106708    0 H
H                  3    1.49000000    2  106.74624364    1  154.52938836    0 H
H                  3    1.49000000    2  111.70725697    1  -94.47817091    0 H
H                  2    1.49000000    1  111.47787282    6  161.98792599    0 H
H                  2    1.49000000    1  111.45278295    6   47.06648780    0 H
H                  8    1.49000000    3  113.93312442    2  -85.61353112    0 H
H                  8    1.49000000    3  106.53485131    2  160.77577023    0 H
H                 18    1.49000000   16   86.82766822   12   75.74807496    0 H
H                 18    1.49000000   16   77.36196575   12 -177.99842047    0 H
H                 18    1.49000000   16  161.67768688   12  -73.50744319    0 H
H                 16    1.49000000   12  156.07470270   11  147.76354219    0 H
H                 16    1.49000000   12   72.18574473   11 -114.24341872    0 H
H                 12    1.49000000   11  106.12782966   10 -155.41022400    0 H
H                 12    1.49000000   11  110.66639574   10   97.46363577    0 H
H                 11    1.49000000   10  112.93590202    7 -163.04656897    0 H
H                 11    1.49000000   10  112.44987197    7  -44.88203194    0 H
H                 10    1.49000000    7  126.79727308    6  164.96473573    0 H
H                 10    1.49000000    7  119.06096729    6    9.81069880    0 H
H                 17    1.49000000   15  115.71214557   10  -10.57160904    0 H
H                 17    1.49000000   15   95.82168956   10  101.09833061    0 H
H                  7    1.49000000    6  115.33286575    1   12.14630112    0 H
H                  7    1.49000000    6   96.29374096    1 -100.10700434    0 H
H                  1    1.49000000    6  112.28468507    7 -170.49799745    0 H
H                  1    1.49000000    6  123.57725479    7   53.53903694    0 H
H                 16    1.49000000   12   91.55021941   11   -4.27194665    0 H

想让36号原子朝26号原子运动去scan(就是黑体的那两个原子),怎么设置呀

[ Last edited by wpgo on 2012-4-16 at 13:36 ]
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

dragon0714

铁虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
不太明白lz什么意思,是否可以直接修改坐标?
无往不胜
2楼2012-04-16 16:17:43
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ldzh0531

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
只是原子动还是原子所在的集团一起动?gaussview可以指定scan的。
3楼2012-04-16 23:50:27
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

beefly

专家顾问 (职业作家)

地沟油冶炼专家

使用z矩阵坐标,其中两个原子距离定义为参数。
beefly《西太平洋大学现代英汉词典》[bi:fli]牛肉一般地
4楼2012-04-17 00:13:00
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lishijunzong

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
先把原子序号给改下,写成内坐标的形式。然后scan两原子距离即可
5楼2012-04-17 18:34:50
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

雪比亚麻布

银虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
找到要走的那个原子,在B(bond)后面写参数,例如0.05 10 就代表走10步每步0.05,相当于A到B的距离。
6楼2012-04-25 16:40:28
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 wpgo 的主题更新
信息提示
请填处理意见