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caijj09

木虫 (职业作家)

[求助] 模拟有机分子在固体表面吸附出现问题

我在模拟固体表面吸附有机分子是,出现图一的错误,请问大侠怎么解决?

我的操作步骤:

1,建立晶体结构模型,然后优化,切表面, 分配力场, 删除键,固定非表面原子,再Minimizer, 然后建真空层(厚度为0),建超胞(2x2x1);

2,画好有机分子, 再建一个空的晶体结构(a, b与第一步中超胞的lattice 一致),利用Amorphous Cell 中的Calculation  ——>Packing把有机分子加到 空的晶体结构中;

3,利用Build Layers建第1,第2步的两个晶体结构加载到一起。

4, 利用Dsicover中的Dynamics 跑动力学。 结果就出现图一的错误。

Discover 跑Dynamics出错
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