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MS模拟体系中水分子数目应该怎样设置?
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wangyiyongwz
铜虫
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MS模拟体系中水分子数目应该怎样设置?
大家好!在分子动力学模拟中,添加水分子的数目,一定要根据体系密度来加吗(如果按照设计密度来加的话,水分子数目太多了)?还是水分子的个数可以随便设置?
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2012-04-13 16:53:58
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caijj09
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5楼
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wangyiyongwz
at 2012-04-16 09:17:02:
但是这样的话,我的体系就有一万多个水分子哎~
你的体系要建那么大么?周期缩小些不可以?
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6楼
2012-04-16 09:42:31
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caijj09
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chaizhm: 金币+1, 谢谢~
2012-04-13 19:23:37
如果不是发文章,只是练练手,那你都可以试试,如果想发文章,还是按模拟温度下水的密度进行添加,一般在进行计算时,都需要采用超算 (也称并行计算)。
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wangyiyongwz
2楼
2012-04-13 17:38:36
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luxujie3
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2012-04-14 08:15:35
通过你所模拟的温度下得密度和你所造盒子的大小来手算出分子的个数啊
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3楼
2012-04-14 07:48:06
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wangyiyongwz
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2楼
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Originally posted by
caijj09
at 2012-04-13 17:38:36:
如果不是发文章,只是练练手,那你都可以试试,如果想发文章,还是按模拟温度下水的密度进行添加,一般在进行计算时,都需要采用超算 (也称并行计算)。
求详解~什么叫“按模拟温度下水的密度进行添加”?是按照溶液的密度添加吗?
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4楼
2012-04-16 09:16:05
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