应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

Znn3bq.jpeg
小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » MS » MS模拟体系中水分子数目应该怎样设置？
101/1返回列表
查看: 2550  |  回复: 9
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

wangyiyongwz

铜虫 (小有名气)

[交流] MS模拟体系中水分子数目应该怎样设置？

大家好！在分子动力学模拟中，添加水分子的数目，一定要根据体系密度来加吗（如果按照设计密度来加的话，水分子数目太多了）?还是水分子的个数可以随便设置？
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:

» 抢金币啦！回帖就可以得到:

查看全部散金贴
1楼 2012-04-13 16:53:58
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

caijj09

木虫 (职业作家)
★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
chaizhm: 金币+1, 谢谢~ 2012-04-13 19:23:37
如果不是发文章，只是练练手，那你都可以试试，如果想发文章，还是按模拟温度下水的密度进行添加，一般在进行计算时，都需要采用超算  （也称并行计算）。
赞一下(1人) 回复此楼

» 本帖已获得的红花（最新10朵）

wangyiyongwz
2楼2012-04-13 17:38:36
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

luxujie3

金虫 (著名写手)
★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
zh1987hs: 金币+1, 谢谢 2012-04-14 08:15:35
通过你所模拟的温度下得密度和你所造盒子的大小来手算出分子的个数啊
赞一下 回复此楼
3楼2012-04-14 07:48:06
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wangyiyongwz

铜虫 (小有名气)
送鲜花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by caijj09 at 2012-04-13 17:38:36:
如果不是发文章，只是练练手，那你都可以试试，如果想发文章，还是按模拟温度下水的密度进行添加，一般在进行计算时，都需要采用超算  （也称并行计算）。

求详解~什么叫“按模拟温度下水的密度进行添加”？是按照溶液的密度添加吗？
赞一下 回复此楼
4楼2012-04-16 09:16:05
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wangyiyongwz

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by luxujie3 at 2012-04-14 07:48:06:
通过你所模拟的温度下得密度和你所造盒子的大小来手算出分子的个数啊

但是这样的话，我的体系就有一万多个水分子哎~
赞一下 回复此楼
5楼2012-04-16 09:17:02
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

caijj09

木虫 (职业作家)
★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
zh1987hs: 金币+1, 鼓励讨论 2012-04-16 10:05:49
引用回帖:
5楼: Originally posted by wangyiyongwz at 2012-04-16 09:17:02:
但是这样的话，我的体系就有一万多个水分子哎~

你的体系要建那么大么？周期缩小些不可以？
赞一下 回复此楼
6楼2012-04-16 09:42:31
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wangyiyongwz

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
6楼: Originally posted by caijj09 at 2012-04-16 09:42:31:
你的体系要建那么大么？周期缩小些不可以？

缩小周期的话，体系的密度不就变大了吗（和实际的密度就不符合了）!
赞一下 回复此楼
7楼2012-04-16 10:44:51
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

caijj09

木虫 (职业作家)
★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
zh1987hs: 金币+1, 谢谢 2012-04-16 13:41:46
引用回帖:
7楼: Originally posted by wangyiyongwz at 2012-04-16 10:44:51:
缩小周期的话，体系的密度不就变大了吗（和实际的密度就不符合了）!

体系的密度是可以设定的呀。你在用AC建盒子的时候，需要你填密度的。
赞一下 回复此楼
8楼2012-04-16 12:59:22
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wangyiyongwz

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
8楼: Originally posted by caijj09 at 2012-04-16 12:59:22:
体系的密度是可以设定的呀。你在用AC建盒子的时候，需要你填密度的。

密度我已经设定了，但在溶质分子个数不变的情况下，体系中放10水分子，和放1000个水分子，体系的密度和设定的一致，不会变吗？
赞一下 回复此楼
9楼2012-04-16 17:04:10
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

caijj09

木虫 (职业作家)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
9楼: Originally posted by wangyiyongwz at 2012-04-16 17:04:10:
密度我已经设定了，但在溶质分子个数不变的情况下，体系中放10水分子，和放1000个水分子，体系的密度和设定的一致，不会变吗？

不懂。。。啥叫溶质分子不变？你体系小了，分子自然少了呀
赞一下(1人) 回复此楼
10楼2012-04-16 23:23:22
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 wangyiyongwz 的主题更新
101/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 国自然面上和省基金B类撒花 +16 花田半亩～白 2026-04-21 16/800 2026-04-23 03:04 by 魅力紫翼
[考研] 312求调剂 +3 山河似你温柔 2026-04-22 3/150 2026-04-22 20:17 by 学员JpLReM
[考博] 华师大读博 +3 xq83 2026-04-22 5/250 2026-04-22 10:42 by xq83
[论文投稿] 急需审稿人！！！ +3 陆小果画大饼 2026-04-21 3/150 2026-04-21 23:54 by jzy_123456
[考博] 申博/考博 +4 啃面包的小书虫 2026-04-17 8/400 2026-04-21 16:26 by 啃面包的小书虫
[考研] 295分求调剂 +6 ?要上岸? 2026-04-17 6/300 2026-04-21 08:18 by Equinoxhua
[论文投稿] 有没有接收比较快的sci期刊呀，最好在一个月之内的，研三孩子求毕业 20+4 之护着 2026-04-16 7/350 2026-04-20 15:45 by 豆豆7758
[考研] 337求调剂 +3 jyz04 2026-04-18 3/150 2026-04-20 12:24 by 研可安
[考博] 申博 +3 Xyyx. 2026-04-18 3/150 2026-04-20 10:44 by YuY66
[考博] 湖南大学刘巧玲课题组2026年第二批次博士研究生招生信息 +3 南风观火 2026-04-18 5/250 2026-04-20 10:13 by 南风观火
[考研] 求计算机方向调剂 +3 Toffee2 2026-04-16 6/300 2026-04-19 22:37 by ll叶
[考研] 294求调剂 +8 淡然654321 2026-04-17 9/450 2026-04-19 19:51 by Equinoxhua
[考研] 304求调剂 +8 castLight 2026-04-16 8/400 2026-04-19 17:14 by 中豫男
[考研] 求调剂 +10 小聂爱学习 2026-04-16 12/600 2026-04-19 16:51 by 中豫男
[考研] 求调剂 +6 苦命人。。。 2026-04-18 7/350 2026-04-19 16:27 by 中豫男
[考研] 接受任何调剂 +6 也就是栗子 2026-04-17 7/350 2026-04-18 17:20 by 涵竹刘
[考研] 收到复试调剂但是去不了 +8 小蜗牛* 2026-04-16 8/400 2026-04-18 11:15 by zixin2025
[考研] 260求调剂 +4 Zyt1314520.. 2026-04-17 5/250 2026-04-18 08:28 by babysonlkd
[有机交流] 二苯甲酮酸类衍生物 50+3 小白爱主人 2026-04-17 6/300 2026-04-17 18:47 by kf2781974
[考研] 322求调剂 +6 tekuzu 2026-04-17 6/300 2026-04-17 13:48 by Espannnnnol
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭