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莎姑子

银虫 (初入文坛)

[求助] Real-Time PCR加样过程中的那些细节

急求各位高手哥哥姐姐帮忙啊
做实时荧光定量PCR,做扩增效率的曲线R2如何才能达到0.99以上,加样过程中有哪些细节需要注意的,使用枪的过程中又有哪些需要注意的,各位高手指点下吧,每次做出来的曲线基本都不好,愁死我了啊
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莎姑子

银虫 (初入文坛)

莎姑子: 回帖置顶 2012-04-11 19:00:05
各位大哥大姐们啊,给点指点吧
10楼2012-04-11 18:57:45
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atlanticwi

金虫 (正式写手)

琴美喜欢发呆 不喜欢发脾气

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
小丹木木: 金币+3, 热心又专业,欢迎常来本版,建议做专家顾问吧 2012-04-11 13:57:15
莎姑子: 金币+2, 有帮助 2012-04-11 15:27:03
嗯.............
偶来了
1. 加样枪最好专用,并定期矫正,能使用吉尔森某款具有锁定功能的枪最好,eppendorf的reserch系列好像基本都没有锁定量程功能
2. 技术误差大,有一部分也是你没有混合好PCR成分的原因,所有PCR成分在用前必须尽量涡旋完全(不过也有报道指出涡旋对酶不好,所以要是担心这点,请颠倒混匀20X以上以达到充分效果)
3. 模板和Mix混合时,尽量选择稀释过的模板,不要取0.5ul以下体积的模板,稍微枪头上带点的话,就能引起误差,如果非要选择吸取0.5ul以下的模板,请采用倒置吸量法,即二档吸取一档打。混合时强烈涡旋1min以上
4. 加样请使用优质硅化枪头,绝对要一次打干净液体,若用96孔板,倾斜一定角度贴壁缓慢(不是很慢的那种)加比较有效果,若用8连管,枪头贴壁倾斜角度反而不能过大,同时注意不要加到盖子能碰到的地方
以上个人经验 若有说错希望高手指正哦
Let God do with it as He wills
2楼2012-04-11 11:45:29
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孙启亮

金虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
小丹木木: 金币+2, 专家考核, 哪有,很专业的说 2012-04-11 13:57:57
一楼专家解释的已经很完整了。人家很专业,咱没法比,但是我的小经验还是送给你吧。感觉你的问题不是出在污染这一块,而是稀释的时候没做好,导致Ct值变化不呈现一定的规律性。由于八排连管容量小,加之你的体系少,这样就产生一个问题,就是你在稀释的时候液体由于受管底表面张力和静电的作用而不能很好的流动,这就是导致稀释不好的真正原因。这种缺陷对低拷贝基因的影响尤其大。解决方法是稀释的时候推干净模板的时候赶紧换枪头,因为枪头外围也会粘连上一个浓度梯度的模板,不换会产生很大影响。稀释的时候不要用枪头反复吹打,几次就可以了。然后轻微的涡旋一下,因为剧烈的涡旋可能会对体系产生影响。最后实在不行的话,换荧光,多尝试一下
3楼2012-04-11 13:08:48
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风逝zhilv

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
还有一点个人呢觉得很重要的就是,加样的时候手法要一致、要准,操作中的一点点误差会使扩增后的误差会很大,祝好运!
为梦想而努力,不做生活的奴隶!
4楼2012-04-11 13:47:05
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