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古木天恕木虫 (正式写手)
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[求助]
进化树N-J法模型选择
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| 求助！大家进化树都用的什么模型？做出来的差别大吗？ |
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11楼2015-12-23 09:18:24
molecula
铁杆木虫 (著名写手)
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【答案】应助回帖
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感谢参与，应助指数 +1
古木天恕: 金币+5, ★★★★★最佳答案 2012-04-09 14:01:44
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古木天恕: 金币+5, ★★★★★最佳答案 2012-04-09 14:01:44
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一般来说 进化树都是用NJ模型 做出来的差别大不大不跟模型相关，跟你在GenBank筛选用来做进化树的基因序列的亲缘性远近有关。 这个东西一句两句说不清楚，给你举个例子吧： A跟B是亲戚，直系； A跟C是旁亲，A跟D是路人，A是黄种人，E是白人，F是黑人。 好了，选取这几个标本用来做进化树，做出来梯度是非常分明的，一般没什么问题，可信度也不错。 如果你选择的是A跟M是直系，A跟N是直系，A跟O是直系，A跟P是直系。 这几个做，做出来非常难看。生物信息学的东西，你去看看，有用。 加我好友吧，我分享给你一个生物信息学进化树制作专题。 这个是我的老师做的课件PPT，你不要外传。 |
2楼2012-04-08 23:59:48
molecula
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4楼2012-04-09 00:00:55
5楼2013-01-19 23:25:49