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分层计算和公式E oniom= E high(model) +E low(real)-E low(model)之间关系的疑问
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众所周知，分层计算中关于能量的计算公式为： E oniom= E high(model) +E low(real)-E low(model) 关于该公式我个人理解E high(model)表示用高基组计算的那部分的能量，E low(real)表示用低基组计算的整个物质的能量，E low(model)表示用低基组计算整个物质的能量。 要知道总的E oniom，就得分别对客体分子进行高基组计算，主体分子进行低基组计算，整个的复合物再进行低基组计算。那既然如此，好像还有什么必要进行分层计算呢？求解答，谢谢。 [ Last edited by 可米kemi on 2012-4-7 at 01:08 ] |
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4楼2012-04-08 04:27:39
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【答案】应助回帖
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gmy1990: 金币+3 2012-04-07 11:53:33
可米kemi: 金币+5, 哦。那在分层计算中应该怎么求能量呢？我只知道输出文件最末尾有个生成热(HF). 2012-04-08 00:56:37
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gmy1990: 金币+3 2012-04-07 11:53:33
可米kemi: 金币+5, 哦。那在分层计算中应该怎么求能量呢？我只知道输出文件最末尾有个生成热(HF). 2012-04-08 00:56:37
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你理解错了. E(Model, High)是高方法描述活性区域时的能量, E(Model, Low)是低方法描述活性区域是的能量. E(Real, Low)才是低方法描述整体时的能量. Low和High是人为定的, 不见得是小基组和大基组, 可以是两个不同的方法. 还有Model和Real也不对应你所说的主客体分子. Model是活性区域, 是你针对具体体系不同研究目的人为划分. 如果你关心主客体分子之间的相互作用, 那显然要把主客体分子间相互作用的那部分区域划进Model中才可以. |
2楼2012-04-07 10:58:24
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3楼2012-04-07 13:54:44
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5楼2012-04-09 08:32:45
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