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hzdtctc

新虫 (初入文坛)

[求助] TRFLP峰与文库预期不一致的问题

得到t-rflp结果后,发现峰和用文库预期的峰有6bp的差异,如果是系统误差应该没有这么大,所有实验得到的峰都比预期小6bp左右,请问有人遇到过同样的问题吗,内标(我已经检查过没有问题)?要解决倒是很简单,把峰右移就行了,因为两个峰的差值和预期还是一致的,所以还是能够说明得到的峰是预期的那个微生物种群。但是峰差6bp的原因是什么呢?

比如在图中两个峰显示的是316.6和618.9;但是我通过文库预期的是321和625,为什么会有这种差异呢?
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416114799

至尊木虫 (知名作家)

引用回帖:
9楼: Originally posted by kiruwa at 2013-09-17 00:38:24
我一般会出现三到四个碱基的误差,六个也在允许范围之内.有的时候,DNA的空间叠加构型会导致误差的出现.

您好!我也请教一个问题,如果附近有很多片段长度相差几个碱基的峰,那么怎么算呢?

你看我的图,100偏下一点,那么多堆在一起,算作一个么?谢谢
TRFLP峰与文库预期不一致的问题
360桌面截图20141227150152.jpg

做人做事要低调,默默践行心中的梦想.
11楼2014-12-27 15:06:23
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hzdtctc

新虫 (初入文坛)

自己顶...

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
2楼2012-04-05 09:19:23
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hzdtctc

新虫 (初入文坛)

还是没有人么~

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
3楼2012-04-06 11:51:13
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hzdtctc

新虫 (初入文坛)

真没人知道么 再顶顶~

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
4楼2012-04-10 09:14:25
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