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TRFLP峰与文库预期不一致的问题
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TRFLP峰与文库预期不一致的问题
得到t-rflp结果后,发现峰和用文库预期的峰有6bp的差异,如果是系统误差应该没有这么大,所有实验得到的峰都比预期小6bp左右,请问有人遇到过同样的问题吗,内标(我已经检查过没有问题)?要解决倒是很简单,把峰右移就行了,因为两个峰的差值和预期还是一致的,所以还是能够说明得到的峰是预期的那个微生物种群。但是峰差6bp的原因是什么呢?
比如在图中两个峰显示的是316.6和618.9;但是我通过文库预期的是321和625,为什么会有这种差异呢?
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1楼
2012-04-04 22:48:33
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9楼
:
Originally posted by
kiruwa
at 2013-09-17 00:38:24
我一般会出现三到四个碱基的误差,六个也在允许范围之内.有的时候,DNA的空间叠加构型会导致误差的出现.
陈贴了,居然还有更新~多谢多谢
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10楼
2013-09-22 23:00:37
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2楼
2012-04-05 09:19:23
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还是没有人么~
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3楼
2012-04-06 11:51:13
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真没人知道么 再顶顶~
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4楼
2012-04-10 09:14:25
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