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忆-雪

银虫 (小有名气)

[求助] 急求RT-PCR电泳图分析已有1人参与

急求各位高手忙我分析分析这是什么原因,第一张和第3张图右边的条带呈涂抹状,这是为什么?
图1:退火温度55度,为什么与marker相邻的两孔目的条带上下有条带,而另外两空却没有?(前两空和后两空模板合成时间不一样,后两孔模板合成快1周了,前两空是今天合成的。)
图2:退火温度58度,为什么后面几个条带呈涂抹状,是因为退火温度太高了吗?内参条带很亮,内参条带旁边的两空的条带跟我参考的文献片段长短不一样,文献报道是266bp,而我扩增出来的是300多bp,我合成的引物跟文献完全一致,这是为什么,难道这不是我的目的基因吗?我重复试验3次,结果都一样。
图3:退火温度48度,结果同图2后面条带一致,呈涂抹状,我试过50度,55度,结果都是涂抹状,这是为什么?
扩增体系是20ul,其中引物1ul,cDNA2ul
PCR条件:94度,5min;94度 30s;退火温度上述温度;72度45s,循环30次,72度 7min.

现在很是惆怅,希望各位高手帮我这菜鸟分析分析!

内参图,退火温度55度



内参和样品图



48度样品图
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mamadexiao

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
忆-雪: 金币+5, ★★★很有帮助 2012-03-31 10:11:14
模板的量我觉得有点大,我跑100ul的体系的时候一共加2ulcDNA
另外,你说的你的引物是文献的,你做了BLAST了么
有时候文献的引物会写错一两个碱基。。。自己仔细比对下
另外,做之前,要做个内参,看看你模板的质量。。。
祝好运
10楼2012-03-30 19:34:49
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