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wyhzj1987

铜虫 (小有名气)

[求助] 关于IRC路径跟踪的问题

各位高手,我想请问一下关于过渡态IRC路径跟踪计算的问题,我想问一下大家IRC的结果怎么分析,是不是IRC计算结果的两边最小能量值就是反应物和产物的能量值,不过不是,是不是就是说明过渡态不正确,还是IRC计算曲线只是说明一个反应的趋势,而最小能量值并不一定就是反应物和产物的能量,我对这个问题很纠结,请大家指导一下,谢谢!
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scottfreedom

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
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wyhzj1987: 金币+5, ★★★很有帮助 2012-03-26 09:25:45
小红豆: 金币+3, 3X 2012-03-28 21:59:54
第一,楼主,我建议你去看看高斯的说明书,里面会有很详尽的算例告诉你,IRC怎么分析,这是链接http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=3716640
第二,反应物和产物的能量值,是由你在算过渡态时给的物质来看的,过渡态只存在于基元反应中,它是一个瞬间的高能状态。
Terse
2楼2012-03-25 23:41:45
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ldzh0531

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
wyhzj1987: 金币+5, ★★★很有帮助 2012-03-28 13:15:07
小红豆: 金币+3, 3X 2012-03-28 22:00:01
IRC两边跑出来的构型要提取出来然后优化,能优化到已知构型的就说明要找的过渡态就是对的。
3楼2012-03-26 20:31:04
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醒目苹果倪1707

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
小红豆: 金币+3, THX 2012-03-28 22:00:11
IRC计算曲线只是说明一个反应的趋势,而最小能量值并不一定就是反应物和产物的能量。。。一个势能面可以很复杂,任何一条路径可能有很多极小点。所以不一定是反应物和产物。要提出IRC前后的结构优化,看看构型
4楼2012-03-27 22:17:34
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xk6891

至尊木虫 (著名写手)

wyhzj1987: 回帖置顶 2012-03-28 13:15:30
想请教一下LZ,IRC计算一般需要多长时间啊~是和原子类型,原子多少有关么~我自己的电脑从早晨算到现在已经十几个小时了,还没有计算完~
人生自古多险阻,勤者自得天酬助。试问否泰何所依,枯藤老枝待新抽。临渊踌躇终迈步,振翅鹏起云霄冲。似是前程甚堪忧,他日振臂揽苍穹。
5楼2012-03-28 00:35:59
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wyhzj1987

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
5楼: Originally posted by xk6891 at 2012-03-28 00:35:59:
想请教一下LZ,IRC计算一般需要多长时间啊~是和原子类型,原子多少有关么~我自己的电脑从早晨算到现在已经十几个小时了,还没有计算完~

十几个小时不算长呀,我一般都要两三天才能算完,我还是用的服务器,肯定和原子多少有关系
6楼2012-03-28 13:14:55
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xk6891

至尊木虫 (著名写手)

引用回帖:
6楼: Originally posted by wyhzj1987 at 2012-03-28 13:14:55:
十几个小时不算长呀,我一般都要两三天才能算完,我还是用的服务器,肯定和原子多少有关系

哦,好。那我就有信心了,我就是试验一下,苯甲醛和甲醇的反应(http://msky.in/?p=427)。那我继续……
人生自古多险阻,勤者自得天酬助。试问否泰何所依,枯藤老枝待新抽。临渊踌躇终迈步,振翅鹏起云霄冲。似是前程甚堪忧,他日振臂揽苍穹。
7楼2012-03-28 20:58:53
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