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请教哈 P63/m空间群的晶体的O氢如何加
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wzgynkmlhf
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[交流]
请教哈 P63/m空间群的晶体的O氢如何加
我的晶体空间群是非常对称的p63/m空间群。我只有一个配位水和一个游离水需要加氢
陪水上的氢我用找Q峰的方式加的,加了2个氢,但是图中出现三个氢,在XP中也是一样。
游离水上的氢我找了一个Q峰,只加了1 个氢,同样grow 后就出现三个氢了,
请高手指点。
图是在Hg中画的。
O1 6 0.57328 -0.06940 0.25000 10.50000 0.03124
AFIX 3
H1A 2 0.54884 -0.06803 0.18953 10.50000 -1.20000
H1B 2 0.70254 0.02750 0.25000 10.50000 -1.20000
AFIX 0
O1W 6 0.33333 0.66667 0.08369 10.33330 0.00914
H1WA 2 0.30568 0.71787 0.03393 10.33330 0.00001
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3楼
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Originally posted by
r2rr2r
at 2012-03-19 15:56:36:
O1W的占有率是0.3333,意味着它处于三重对称位置。跟在它上面的H能长出3个来不奇怪。这可以理解为一个水分子的三重无序。只要把握准了H的数量是O的两倍就行了。
我需要解决的是,O1上的氢加了以后,会在120°上三重轴上出现3个,O1w上的氢我加了2个。1、画图的时候需要画氢吗?可以不画吗?氢原子这种样子算无序吗?
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2012-03-19 17:02:50
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wzgynkmlhf: 金币+5, 能否解释哈为何出现三个氢?有无相关文献、若解决问题,金币全给您。谢谢。
2012-03-19 15:34:11
O1位于两重对称位置?它上面的H不用动。
O1W上的H,占有率修成10.6667即可。
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2012-03-19 15:23:06
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lichun1210: 金币+10, 替楼主给bb
2012-04-28 17:04:22
O1W的占有率是0.3333,意味着它处于三重对称位置。跟在它上面的H能长出3个来不奇怪。这可以理解为一个水分子的三重无序。只要把握准了H的数量是O的两倍就行了。
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2012-03-19 15:56:36
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算无序。
溶剂水分子可以不画。但是配位的水分子一定要画,只要画出其中一种无序状态即可。图注中说明无序状态和溶剂水分子未画出。
楼主的主贴内容是O1上两个H(二重对称位置),O1W上1个H(三重对称位置)。
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5楼
2012-03-19 17:29:56
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