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mahoumeimei

金虫 (小有名气)

[求助] RNA电泳

各位，我的RNA电泳结果很差，是降解了吗？（最左边是生工的100bp DNA ladder）我是刚提完就跑的电泳，是提取过程中操作不当吗？

RNA电泳
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1楼 2012-03-12 10:20:29
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a731705125

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
mahoumeimei(金币+1): 2012-03-12 20:05:42
小丹木木(金币+5): 鼓励应助 2012-03-13 10:30:55
引用回帖:
3楼: Originally posted by mahoumeimei at 2012-03-12 15:00:57:
我提取用的枪头是买的一次性的，实验台和移液枪都喷了酒精了，实验过程中都带着口罩和干净手套，求教还有哪里可能没注意到啊？急！急！急！

转自生物秀http://www.bbioo.com/experiment/13-1223-1.html
1、RNase 是RNA制备的杀手
RNase酶非常稳定，是导致RNA降解最主要的物质。它在一些极端的条件可以暂时失活，但限制因素去除后有迅速复性。用常规的高温高压蒸气灭菌方法和蛋白抑制剂都不能是RNase完全失活。它广泛存在于人的皮肤上，因此，在与RNA制备有关的分子生物学实验时，必须戴手套。RNase的又一污染源是取液器。根据取液器制造商的要求对取液器进行处理。一般情况下采用用DEPC配制的70%乙醇擦洗取液器的内部和外部，基本达到要求。取RNase-free的物品时必须戴手套。
2、塑料制品、玻璃和金属物品的处理
(a)塑料制品：尽可能使用无菌，一次性塑料制品。已标明RNase-Free 的塑料制品，如没有开封使用过，通常没有必要再次处理。对于国产塑料制品，原则上都必须处理方可使用。处理方法如下：
(1)在玻璃烧杯中注入去离子水，加入DEPC使DEPC的终浓度为0.1%。注意：DEPC为剧毒物，活性很强，小心在通风柜中使用。
(2)将待处理的塑料制品放入一个可以高温灭菌的容器中，注入DEPC水溶液，使塑料制品的所有部分都浸泡到溶液中。
(3)在通风柜中室温处理过夜。
(4)将DEPC水溶液小心倒到废液瓶中，用铝箔封住含已DEPC水处理过的塑料制品的烧杯，高温高压蒸气灭菌至少30分钟。
(5)烘箱用合适的温度烘拷至干燥。置于干净处备用。
(b)玻璃和金属物品
250°C烘烤3小时以上。
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6楼2012-03-12 18:55:20
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karin

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
mahoumeimei(金币+2): 2012-03-12 20:05:20
你提取的RNA量太低而且降解严重。正常RNA电泳应该有28s、18s、5s三条带，28s的带的亮度约是18s带的两倍，最低也得等同，一般提取情况下5s的带很少见。你的RNA基本都降解了，建议认真彻底处理提取用具及环境！
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坚持就是胜利
2楼2012-03-12 12:29:14
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mahoumeimei

金虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by karin at 2012-03-12 12:29:14:
你提取的RNA量太低而且降解严重。正常RNA电泳应该有28s、18s、5s三条带，28s的带的亮度约是18s带的两倍，最低也得等同，一般提取情况下5s的带很少见。你的RNA基本都降解了，建议认真彻底处理提取用具及环境！

我提取用的枪头是买的一次性的，实验台和移液枪都喷了酒精了，实验过程中都带着口罩和干净手套，求教还有哪里可能没注意到啊？急！急！急！
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3楼2012-03-12 15:00:57
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karin

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
小丹木木(金币+2): 鼓励 2012-03-13 10:30:25
mahoumeimei: 金币+1 2012-03-27 11:28:42
引用回帖:
3楼: Originally posted by mahoumeimei at 2012-03-12 15:00:57:
我提取用的枪头是买的一次性的，实验台和移液枪都喷了酒精了，实验过程中都带着口罩和干净手套，求教还有哪里可能没注意到啊？急！急！急！

跑电泳的东西也是要处理的。我以前是用试剂盒提取的，所用的管子和枪头也都是买的去RNase的，把制胶的模具和电泳槽用DEPC处理，提取过程尽量迅速，效果还是不错的。你是提取的甚么的RNA呢？
    祝实验成功！
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坚持就是胜利
4楼2012-03-12 17:08:26
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