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丫头good

银虫 (初入文坛)

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专业: 环境微生物学

[求助] 土壤真菌PCR-DGGE中真菌ITS区引物的选择

本人初涉分子，要做有关土壤中真菌总菌的PCR-DGGE方面的实验，查阅了一些文献，现有几个问题向大侠们请教。
1.查阅了一些文献，看到所用真菌ITS区的引物有多种：ITS1/ITS2;ITS1/ITS4;ITS4/ITS5;ITS1-F/ITS2;ITS1-F/ITS4等。弱弱的问一句，我该怎么选择引物，这些引物在应用中有什么区别？
2.GC结构应放在上游还是下游，看文献中放在上游的也有，放在下游的也有，我该怎么选择？
谢谢大家！

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1楼2012-03-10 21:16:17

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木子勇夏

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专业: 环境微生物学

2楼的老前辈，我就是看到了你上面说的这对引物GCFung+NS1 出来的条带很好，可是我按照他的条件跑出来的结果却是条带分不开，不知道是为什么呢？

8楼2013-01-05 17:13:28

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木子勇夏

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感觉真菌的真的是不好做啊，细菌比较好做些

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9楼2013-01-05 17:14:08

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