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南方科技大学公共卫生及应急管理学院2026级博士研究生招生报考通知(长期有效)
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黑狼鸟

新虫 (初入文坛)

[求助] 新手无脑问题,希望有人解答~谢谢!(句法错误)

本科生做毕业设计....
先说一下文件来源,我首先用mercury把从ccdc所要的TXT晶体文件变成pdb格式,然后用gaussian view稍微修改一下,拆成几个片段,之后转换成gjf文件,可是在跑任何opt命令时都报错,说是原子的信息的第一栏有句法错误。但是跑一些geom命令确跑的起来,但是在解自洽场方程时会出现rare condition,反复的解啊解...
我的那个原子的信息是这样的。(如下)

1 2 1.0 4 1.0 5 1.0 6 1.0 7 1.0 48 1.0
2 3 1.0 10 1.5
3 11 1.5 46 1.0
4 12 1.5 19 1.5
5 20 1.5 27 1.5
6 29 1.5 36 1.5
7 37 1.5 44 1.5
8 9 1.0 10 2.0 11 2.0
9
省略下面的东西了....

问题就在第一行,报错原文如下
QPErr --- A syntax error was detected in the input line.
  1 2 1.0 4 1.0 5 1.0 6 1.0 7 1.0 48 1.0

初始的命令是
# hf/3-21g opt

求指点迷津!谢谢各位了先!!
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ldzh0531

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
原子信息??是内坐标还是直角坐标? 你贴的根本看不明白啊!!
4楼2012-03-09 20:46:45
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yjcmwgk

禁虫 (文坛精英)

密度泛函·小卒

优秀版主

先学点儿语文吧
我愣是没看明白你在说什么
2楼2012-03-09 11:05:33
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2008从容

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
请把完整的gjf文件贴出来看一下
3楼2012-03-09 20:08:44
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黑狼鸟

新虫 (初入文坛)

好了,删了就好了
5楼2012-03-10 14:59:20
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