24小时热门版块排行榜    

查看: 2964  |  回复: 13
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

jingdejun

铁杆木虫 (小有名气)

[求助] 引物设计的问题

先说明一下,我是在前人的基础上做的实验,但是这个基础有点不扎实(因为她不是很懂分子方面的东西,为了毕业论文才硬着头皮做的)。

她利用真菌的通用引物从出发菌株(自己筛选的,后来鉴定出来是产黄青霉菌)中克隆出了一个核酸片段(号称是脂肪酶,因为原始菌株有脂肪酶活性),并且已测序。我就是在这个序列的基础上开展我的工作。我要做的是克隆和真核表达这个基因。

首先要设计引物。而第一步就是要找出保守序列。我通过ncbi的blast,发现此序列中只有一个保守区段(在上游),所以上游引物可以根据这个保守区段设计。

可是下游引物应该怎样办呢?

再就是即便我克隆出了这个片段,我怎样确定它就是对应的脂肪酶的基因呢?

本人第一次求助,希望可以得到帮助啊,谢谢。
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jingdejun

铁杆木虫 (小有名气)

引用回帖:
: Originally posted by liuyu_sdili at 2012-03-06 15:22:20:
估计你应该先做反转录。可以考虑一下扩增未知片段的一些方法,比先设计随机引物(用它作为下游引物)做个热不对称交错PCR(TAIL-PCR),然后再用RACE扩增两翼的片段。对于鉴定,应该需要做蛋白质序列分析与基因编 ...

巢式PCR的下游引物是简并引物啊。
用随机引物可以做吗?
3楼2012-03-06 16:13:05
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 14 个回答

liuyu_sdili

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
jingdejun(金币+2): 有帮助 先鼓励一下。 2012-03-06 16:13:59
西瓜(金币+2): 鼓励应助! 2012-03-07 12:20:33
估计你应该先做反转录。可以考虑一下扩增未知片段的一些方法,比先设计随机引物(用它作为下游引物)做个热不对称交错PCR(TAIL-PCR),然后再用RACE扩增两翼的片段。对于鉴定,应该需要做蛋白质序列分析与基因编码氨基酸的序列的比对吧~~~
一家之言,仅供参考~~~
2楼2012-03-06 15:22:20
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

liuyu_sdili

木虫 (正式写手)

这个,我的帖子里面好像没有提到过巢式pcr?
4楼2012-03-06 19:55:58
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jingdejun

铁杆木虫 (小有名气)

引用回帖:
: Originally posted by liuyu_sdili at 2012-03-06 19:55:58:
这个,我的帖子里面好像没有提到过巢式pcr?

“热不对称交错PCR(TAIL-PCR)”,也叫巢式pcr。
5楼2012-03-06 20:53:02
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[博后之家] 售SCI文章,我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 ero8OE6tv9cu 2026-09-02 6/300 2026-09-02 23:59 by rM1TE0WVDIIY
[公派出国] 售SCI-T0P文章,我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 ero8OE6tv9cu 2026-09-02 3/150 2026-09-02 22:50 by rM1TE0WVDIIY
[基金申请] 为什么资助数各大高校都创新高,自己申请怎么就这么难 +14 Kittylucky 2026-08-27 15/750 2026-09-02 19:35 by liumei0601
[基金申请] 科研人应该花精力去思考如何解决问题,而不是去凝练问题 +7 瞬息宇宙 2026-09-01 14/700 2026-09-02 17:33 by ma0526
[基金申请] 要骂人了,新模版改版就是要淡化问题凝练这种虚的东西,结果有个评委还在说凝练得不够 +9 瞬息宇宙 2026-08-31 17/850 2026-09-02 14:04 by anjeeshine
[基金申请] 基金系统什么内容也没有 30+4 winsaint 2026-08-27 10/500 2026-09-02 11:35 by 大不刘6
[基金申请] 学科评审组评审是指会评吗? +5 瞬息宇宙 2026-08-31 5/250 2026-09-02 10:13 by 雨冰共舞
[基金申请] 面上合作单位盖章 +6 ssyjh 2026-08-27 9/450 2026-09-01 20:01 by huagongfeihu
[论文投稿] 小白求助 投论文要求的highlights应该如何写 5+3 l1963982152 2026-08-29 4/200 2026-09-01 09:04 by 北京莱茵编辑
[基金申请] 国社科又开始会评了,不知道这次命运如何 +7 雨打竹帘 2026-08-30 11/550 2026-08-31 23:16 by hittle2008
[基金申请] 基金未中,这种答复是模板吗? +6 zhaosm1982 2026-08-27 7/350 2026-08-31 21:18 by qdxxmc
[基金申请] 面上意见出来了 +12 黄鸟于飞Chao 2026-08-29 23/1150 2026-08-31 18:57 by 黄鸟于飞Chao
[基金申请] 能否申诉? +7 echo8914667 2026-08-30 8/400 2026-08-31 17:00 by yihongxu
[基金申请] 中青基了要发朋友圈吗? +7 349506619 2026-08-28 7/350 2026-08-31 13:39 by 冼亮淀粉酶
[基金申请] 29号明天会评吗 +4 笨笨唐 2026-08-28 4/200 2026-08-31 09:30 by huixian257
[基金申请] 有没有仍没收到信息的 +7 德尚中行 2026-08-27 8/400 2026-08-30 20:52 by purplejack
[考博] 找导师 +6 yuanjiabao 2026-08-29 7/350 2026-08-30 14:40 by 生科新手
[基金申请] 我就是申请一个面上项目而已,这评审意见是按照杰青的条件评的吧? +6 gouxfjh 2026-08-28 11/550 2026-08-30 07:57 by gouxfjh
[基金申请] 国自然评审意见 +13 wangmingqi 2026-08-28 19/950 2026-08-29 10:22 by Poppy1104
[基金申请] 2026年叶企孙基金 +4 bud_bud 2026-08-27 7/350 2026-08-29 07:23 by foolishmani
信息提示
请填处理意见