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simon江

新虫 (小有名气)

[求助] pcr产物琼脂糖凝胶电泳检测部分泳道到出现月牙状带型,求解?

pcr产物琼脂糖凝胶电泳检测部泳道到出现月牙状带型,注明:这八个泳道的产物同时扩增,只是DNA模板不同。求解


[ Last edited by simon江 on 2012-2-29 at 01:05 ]
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shengxuejs

木虫 (正式写手)

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电压过大,电流过大,出现了边界效应,使得DNA在泳动过程中的速率不均匀。

lz可以尝试:
1,微波炉制胶时用中火煮沸三次,一沸既止,摇匀再煮沸。
2. 适当减少电压与电泳时间。
3. 点样过程速度加快,避免弥散。

注意以上三点,应该能使得目前的状况得到改善。
学无止尽,沧海扁舟。
18楼2012-03-13 10:40:02
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bst5

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

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两点原因
第一:胶没有混匀
第二:梳子没有拔好,建议先把胶倒上,再插梳子
7楼2012-02-29 14:46:02
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xiayongxiu

金虫 (正式写手)

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我有时候跑胶也会跑的很差,师兄说要做一块好胶,首先得让琼脂糖充分溶解,可以多加会儿热,摇匀后在加热,直到溶液澄清没有颗粒状为止;还有就是电压可能太大。你可以重做一块胶试试,换上新的电泳缓冲液。
一切都要靠自己努力
8楼2012-02-29 15:21:00
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gaolijuan913

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

要经常用紫外灯看看,别跑过了,一般20分钟左右就跑开了
nothing
17楼2012-03-01 12:39:45
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gaoyang636

木虫 (著名写手)

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amisking(金币+2): 鼓励发帖交流! 2012-02-29 18:02:25
月牙形集中在胶的下部,跑着跑着就弥散了,是不是跑的时间太长了捏?注意电流不要太大,缓冲液刚刚没过胶最好了
2楼2012-02-29 09:20:37
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cgspider

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

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我们经常叫 牛角 状,是因为电压太大了。。
你的能力撑不起你的野心
15楼2012-03-01 10:33:56
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gaolijuan913

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
1%的胶,10v/cm,上样5ul,你试试。这是我跑胶用的条件,几乎没见过月牙,祝你成功
nothing
16楼2012-03-01 12:38:14
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普通回帖

longrna

新虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

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amisking(金币+2): 鼓励发帖交流! 2012-02-29 18:02:31
楼上的点样孔应该是在底部吧?
怎么这么多条带?条带范围从多少到多少?你胶浓度是多大?
月牙状也没不是没见过,但挺奇怪的是你同一泳道上有些是月牙有些很正常。难道跟上样量有关?
伟大航线....
3楼2012-02-29 09:40:03
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vickie20

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

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电压或者电流太小?如果是太大应该是微笑型……
4楼2012-02-29 10:22:25
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eagle00768

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
引用回帖:
3楼: Originally posted by longrna at 2012-02-29 09:40:03:
楼上的点样孔应该是在底部吧?
怎么这么多条带?条带范围从多少到多少?你胶浓度是多大?
月牙状也没不是没见过,但挺奇怪的是你同一泳道上有些是月牙有些很正常。难道跟上样量有关?

同一泳道上有的正常,有的月牙,是不是因为正常的条带浓度低,月牙状的浓度较高,我觉得应该是电压大的原因
5楼2012-02-29 13:36:34
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longrna

新虫 (正式写手)

引用回帖:
5楼: Originally posted by eagle00768 at 2012-02-29 13:36:34:
同一泳道上有的正常,有的月牙,是不是因为正常的条带浓度低,月牙状的浓度较高,我觉得应该是电压大的原因

有道理。
其实电泳不难,多看看参考marker公司跑marker的条件就可以了,关键要细心。
伟大航线....
6楼2012-02-29 14:11:27
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simon江

新虫 (小有名气)

引用回帖:
: Originally posted by gaoyang636 at 2012-02-29 09:20:37:
月牙形集中在胶的下部,跑着跑着就弥散了,是不是跑的时间太长了捏?注意电流不要太大,缓冲液刚刚没过胶最好了

电泳条件:5v/CM,电泳时间:4.5小时
9楼2012-02-29 15:49:21
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simon江

新虫 (小有名气)

引用回帖:
: Originally posted by longrna at 2012-02-29 09:40:03:
楼上的点样孔应该是在底部吧?
怎么这么多条带?条带范围从多少到多少?你胶浓度是多大?
月牙状也没不是没见过,但挺奇怪的是你同一泳道上有些是月牙有些很正常。难道跟上样量有关?

是的,点样孔在底部,这个是用sts标记的,胶是2%的,上样量6.5ul,整个pcr体系是20ul
10楼2012-02-29 15:50:51
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