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scusmf

铁虫 (初入文坛)

应助: 1 (幼儿园)
金币: 459.3
帖子: 48
在线: 34.8小时
虫号: 1324415
注册: 2011-06-16
性别: GG
专业: 药物设计与药物信息

[求助] 求助：本人新手，想分段同源建模，不知道用什么软件和方法？

想同源建模一个蛋白分子，有一级结构，在DS和SWISS-model上自动建模过，但是都只有部分残基被建模，现在想将序列分段开来建模，再最后连接在一起，即蛋白片段的在组装，不知道有没有高手做过这方面的工作，需要用什么软件，具体方法是什么？求高手指点一二，不胜感激！

[ Last edited by scusmf on 2012-3-1 at 16:44 ]

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1楼2012-02-27 17:01:24

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Tavel

铜虫 (小有名气)

模拟EPI: 1
应助: 2 (幼儿园)
金币: 166.9
散金: 17
红花: 1
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在线: 57.4小时
虫号: 341192
注册: 2007-04-08
性别: GG
专业: 药化

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
zh1987hs: 金币+2, thank you 2012-04-07 18:45:19
scusmf: 金币+2 2012-04-09 09:49:24

你可以用SYBYL中的APM（Advanced Protein Modeling）模块,，它是分步进行模建的，先构建骨架，再构建LOOP区，然后构建侧链......

10楼2012-04-07 17:22:30

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

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