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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 材料区 » 晶体 » 晶体解析 » 虫友结构解析修正问题解答实例
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xi2004

至尊木虫 (职业作家)

[交流] 虫友结构解析修正问题解答实例 已有47人参与

不断有虫友送结构给我看，或问些问题，其中很多是重复的。 我想，还是慢慢整理在一起，放在这里， 供初学者参考。

问题1.  虫友 abcd007140 2012-2-24  问:
解晶体时 运行xprep时 出现了一段红色的提示
no acceptable space group---change tolerances or unset chiral flag or possibly change input lattice type ,then recheck cell using H-option
不知什么意思 如何处理

答：
   你的这个问题，是由于该完全消光的点没有消光，导致程序不能自动判断出空间群。具体原因可能是晶体不够好，或衍射太强等。
   具体到这个结构，实际上，在xprep时，可以看到 h00, 0k0, ool的点明显比其他点弱，是可以看作消光掉了。 所以结构的空间群是P2(1)2(1)2(1). 这个我能自己判断出来。
   你可能还不够熟悉， 不能自己判断， 那么就要改变那个tolerances ，这个怎么做呢？
   在 xprep中，有一步是有那个 [T]选项， 你把其中那个消光判据的sigma值改为 10， 那么程序就能自动为你给出程序了，见我给你的.prp文件。
   在.prp中，可见如下，其中倒数第二行，我是做了改变的：

TOLERANCES CHANGED

Maximum deviation (deg.) in higher symmetry cell search =  1.000
Threshold (deg.) for terminating search =  0.050
R(int) maximum for terminating cell search =  0.120
R(int) maximum for space group determination =  0.300
Minimum number of data in group for syst. absence test =   5
Maximum mean I/sigma(I) for systematic absences = 10.000
Minimum I/sigma gap between absences and rest =  5.000
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xiaopengs ylt p452_1 红叶天雨星 abcd007140 brilliant sunjing120 cf2010 ludongfei lsyang jinhongguang

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xi2004-emuch@163.com
1楼 2012-02-25 13:02:29
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xi2004

至尊木虫 (职业作家)
引用回帖:
47楼: Originally posted by 905238502 at 2013-03-29 14:57:15
Isolated Metal Atom (Unusual !) ................        Ni2
老师我的晶体出现这样的A类错误怎么改啊，我是初学者望老师多帮助，这是我晶体的键长，求老师解答

未命名.jpg
...

金属不可能没键。
修改Ni2原子类型。
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xi2004-emuch@163.com
49楼2013-04-09 13:27:21
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nanjiao_12
3楼2012-02-25 17:31:21
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p452_1

至尊木虫 (知名作家)
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drg1984: 鼓励发帖交流科研上的困惑、困难！ 2012-02-25 23:53:27
我以前也碰到过类似问题，衍射数据很好，就是找不到合适的空间群，需要改变TOLERANCE。向专家学习！
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老歪博
5楼2012-02-25 19:07:33
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红叶天雨星

金虫 (著名写手)
★
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drg1984: 鼓励发帖交流！ 2012-02-25 23:53:38
专家，别人帮我测了几个数据，测试员解不出来，不知道是数据问题还是不能解，如果方便，想请您帮我看看，谢谢
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6楼2012-02-25 21:22:34
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