| 查看: 1683 | 回复: 1 | |||
[交流]
知道基因序列，怎样查功能域＼内含子＼蛋白？ 已有1人参与
|
| 我有目的基因的基因组中序列，就是从ATG到ＴＡＡ部分。如何知道它是不是有内含子？也就是说如何知道它的功能域？如何知道它翻译成的蛋白序列及结构演绎呢？ |
回复此楼» 猜你喜欢
云南大学材料与能源学院解琳课题组钙钛矿博士招生
已经有7人回复
-
西安交大新媒学院副院长用撤稿论文结题
已经有5人回复
-
论文撤稿了
已经有5人回复
-
某211大学教师把个人教师官方主页改成:我跑了我跑了我跑了!官宣跑路！
已经有5人回复
-
26/27申博自荐
已经有9人回复
-
售SCI一区T0P文章，我:8.O.5.5.1.O.5.4,科目齐全,可+急
已经有3人回复
-
售SCI一区T0P文章，我:8.O.5.5.1.O.5.4,科目齐全,可+急
已经有7人回复
-
河北省自然科学基金
已经有7人回复
-
揭秘青基评审内幕：几个A才能顺利中标
已经有4人回复
-
青B发送上会通知了吗
已经有7人回复
tuobaohua
荣誉版主 (文坛精英)
投资理财发言人
- 博学EPI: 7
- 应助: 272 (大学生)
- 贵宾: 2.206
- 金币: 9809.6
- 散金: 12632
- 红花: 89
- 沙发: 258
- 帖子: 10236
- 在线: 2595.7小时
- 虫号: 810838
- 注册: 2009-07-17
- 性别: GG
- 专业: 资源化工
- 管辖: 基金申请
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
wenjing120(金币+1): 积极应助！ 2012-02-28 11:12:37
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
wenjing120(金币+1): 积极应助！ 2012-02-28 11:12:37
|
使用blastn里面的 “Align two or more sequences”，出现两个输入序列的窗口，分别输入基因组序列和mRNA序列，mRNA序列最好只选取CDS输入进去。 出现比对结果后，CDS序列会和基因组相应的部分区域完好的匹配，出现几段区域就应该有几个外显子。 但是这样的比对不能很好的区分内含子和外显子的边界，内含子和外显子的边界序列最好根据GT......AG规则去手动分辨，一般内含子的边界序列都有典型的特征：5'GT......AG3'，同时还要兼顾mRNA各外显子的连续性，不要出现重叠区域。 http://zhidao.baidu.com/question/210709763.html |
2楼2012-02-28 09:40:49
10