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[求助]
用Origin 8.0怎么计算IC50值
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本人想计算抑菌率的IC50值，参照其它的求助贴还是搞不好，希望大家帮帮忙！ 浓度 256 128 64 32 16 8 4 2 1 抑菌率 86.17 50.40 38.61 26.42 20.32 14.63 10.16 7.31 4.065 |
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jiawei8119
铜虫 (初入文坛)
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我使用Origin7.5 1. 先随意输入一组数据吧 2. 选中这2 列数据，然后点左下角的作scatter 图的图标， 3. 然后就生成了散点图 4. 点击Analysis 菜单中的Fit Polynomial，在弹出的对话框中，Order 处设为1，这样就是作线性拟合， 就是勾选对话框中的Show Flormula on graph。(可能Origin 的设计者认为线性拟合公式太简单，默 认就不用显示了) 5. 点击OK 后，就得到了拟合后的图形。线性方程公式也显示在了图形上。注意窗口的右下角。 点击那里的小箭头后，我们可以看到完整的拟合统计信息，如相关系数R2=0.9918 6. 好了，标准曲线知道了，现在就来计算IC50。根据IC50 定义，该例子中就是Y 取中值时，X 对应的 数值，这里Y 的中值是0.6，那根据线性方程就可以自己算出来对应的X 值。那如果不是线性方程，公式 比较复杂手工计算就很麻烦了，所以还是用Origin 中的功能吧。 点击Tools，Linear Fit， 如果不是线性拟合的，请选择其他拟合方式，如果是S 形曲线的，则需要选择 Sigmoidal Fit. 7. 在弹出的对话框中，先点击Fit，然后在Find Y 处输入0.5，点击Find X 按钮，得到的数值就是IC50 了。 |
23楼2018-06-20 13:13:18
xiaoqi5992
银虫 (正式写手)
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【答案】应助回帖
感谢参与，应助指数 +1
苗苗09(金币+8): ★★★很有帮助 2012-02-23 09:09:23
苗苗09(金币+8): ★★★很有帮助 2012-02-23 09:09:23
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我用的是Origin8.5.1，估计操作差不多。先做一个散点图，然后双击横坐标改成log10形式的，最后曲线拟合，选择非线性的growth/sigmoidal----函数选择logistic，直接拟合就可以了。会出一个报告，我这个版本的可以直接给出EC50，8.0我不太清楚，不过要是没有的话也没有关系，你可以看各个参数的值，其中有一个是X0，也就是X的系数，它的值其实就是EC50. 注：我所选用的是四参数拟合 |
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2楼2012-02-23 08:52:20
xiaoqi5992
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【答案】应助回帖
苗苗09(金币+2): ★★★很有帮助 2012-02-23 13:47:31
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Model Logistic Equation y = A2 + (A1-A2)/(1 + (x/x0)^p) Reduced Chi-Sqr 9.80758 Adj. R-Square 0.98587 Value Standard Error B A1 4.08463 4.94721 B A2 217573.10184 4.04732E8 B x0 7.27698E7 2.15451E11 B p 0.62987 0.32689 B EC20 8.05571E6 B EC50 7.27698E7 B EC80 6.57353E8 这是我拟合后的结果 |
3楼2012-02-23 08:54:03
4楼2012-02-23 09:10:43