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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » DS/Sybyl/Autodock » 请教高人，我的pymol软件导入蛋白后进行cartoon时，出现的怎么是loop结构？
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wohaihao

荣誉版主 (著名写手)

保密局的……

[求助] 请教高人，我的pymol软件导入蛋白后进行cartoon时，出现的怎么是loop结构？

教程说应该是cartoon_automatic 那种，很漂亮的。

我用了cartoon automatic命令也不识别，一直是loop结构。

其他的都能掉出来，如arrow等。请教这个默认设置怎么弄？或者是软件本身的问题？
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从小到大就没清闲过，要不就是穷，穷的活着没意思，要不就是累，累得活着没意思，现在是又穷又累了
1楼2012-02-21 18:15:10
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caixin5120

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
wohaihao(金币+2): 谢谢 2012-02-22 16:43:16
zh1987hs(金币+3): 谢谢 2012-02-22 22:12:14
不能是mol2文件，改为pdb文件就对了：） pymol不支持mol2的动画
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6楼2012-02-22 09:50:18
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caixin5120

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

chaizhm(金币+1): 2012-02-23 11:30:35
呵呵 楼上方法是可行的：） 同时sybyl也支持 merge，把蛋白和小分子 就放到一起了，然后保存为pdb文件。
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10楼2012-02-23 10:37:32
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