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老夏853

铁杆木虫 (著名写手)

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[求助] 关于进化树距离请教。

请教一个关于进化树间距离的问题。
1，系统进化树每个分支上都标有的数据究竟代表了什么呢？采用Nj 建的树,
2，如果我想表达进化树中不同分支之间的距离，用这些数字能不能做一个计算，来比较直观的得到一个量化的指标？
比如图中我想计算分支1,4 之间的距离和分支6,8 之间距离，这两个距离哪个更近一些，用什么方法呢？
希望各位不吝赐教有相关的文献资料什么的希望能够提点我下谢谢了啊

[ Last edited by 老夏853 on 2012-2-13 at 09:18 ]

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1楼2012-02-13 09:15:04

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老夏853

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引用回帖:

8楼: Originally posted by frankerry at 2012-02-17 11:32:47:
六楼的朋友说的对。不过我想补充一点。
针对楼主的问题“ 我想计算分支1,4 之间的距离和分支6,8 之间距离，这两个距离哪个更近一些，用什么方法呢？”
1. 如果你想知道分支1,4或者6,8之间的精确遗传距离，要用 ...

你好
我想请教下个问题是关于DGGE 电泳后聚类分析的
因此前面很多人提到的对数据的分析基本上很难实现
我做好的图只有一个聚类关系其他数据我们也看不见，，因为比较粗糙聚类的依据是在同一水平上有无条带进行的所以，就这这个图这样。
所以我想问的是像这张图的话计算c1与F1 以及 C8与F8 之间的距离怎么样计算？请详细赐教。。