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651424759

新虫 (初入文坛)

[求助] overlap PCR做不出来呐。。。。

连接两个片段,分别PCR均P出来,连接做不出来,试过好几次了。片段分别为1500和3000,变性时间2min,延伸5min。求助各位前辈。。。不甚感激!!!
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sd3824289

木虫 (正式写手)

楼主,貌似第二步我也建议你做个梯度试试,做第二轮PCR的时候,由于片段大小发生了变化,GC含量也不一样了,所以退火温度也就跟着发生变化!所以用一下温度梯度很有用的!希望对楼主有帮助!
坚持,就像流星,即使知道最后的结果,也要勇敢的走到最后!
18楼2012-08-27 16:28:54
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imyting

至尊木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
小丹木木(金币+2): 很专业哦,值得学习 2012-01-09 13:36:08
OVERLAPPING PCR一般来说应该分为三步,第一步正是楼主说的分别P两个片段,第二步应该是不加两端引物以两个片段的PCR产物为模板进行3-5个循环(此步骤退火温度可以低点),第三步是在第二步反应终止时加入两端引物条件自定。关键还是退火温度的控制,有时候你P不出来不一定就是你的条件不好。我也试过不经过第二步直接P,也有成功的时候。如果实验室经费比较充裕还是买试剂盒吧,大约50元一次。你也可以把你的PCR条件附上,大家都看看怎么样。
悠哉游哉做实验,成兮败兮我随便
2楼2012-01-09 12:44:15
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fwks3518

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
西瓜(金币+3): 鼓励交流!不过融合后的量一般很少,也可以不纯化直接作为模板大量扩增的。 2012-01-09 17:50:14
1、扩增A: 1.5k和B:3k的两个片段,纯化后备用
2、以纯化后的A、B片段为模板,以A的5‘端引物和B的3’端引物来进行重叠PCR
3、PCR产物胶回收,切4.5K片段纯化。
4、以该片段为模板,大量扩增
3楼2012-01-09 14:12:26
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匿名

用户注销 (正式写手)

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
西瓜(金币+2): 鼓励交流 2012-01-09 17:50:25
651424759(金币+10): ★★★★★最佳答案 各方面的情况都分析到啦,O(∩_∩)O谢谢 2012-01-12 09:44:00
西瓜(金币+3, MolEPI+1): 根据楼主反馈,授予EPI! 2012-01-17 21:18:54
本帖仅楼主可见
4楼2012-01-09 15:11:00
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