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chawk

木虫 (小有名气)

[求助] 请教 径向分布函数(RDF) 问题

本人初学,请大家帮忙分析,先谢过啦。
在分析溶液中高分子链聚集的时候,用到RDF(radial distribution functions) g(r)。
g(r)=*V/(4*pi*r**2*N*(N-1)),
其中:s(r)为相距为r的粒子对数,V是体系体积,N为体系总粒子数。
文献中g(r)都是收敛于1,但我怎么算出来都是收敛于0的?
(个觉得,有限体系中,没有两个粒子间距r为无穷大,所以s(无穷)=0,那么,g(无穷)也=0,怎么会是1呢?)
请牛人指点,最好给个文献能够详细说明的。
谢谢!
(不知道我的问题有没有说清楚,怎么没人来呢?)

[ Last edited by chawk on 2012-1-7 at 21:35 ]
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大家说的太好啦!大家齐努力,改造地球啊!俺是农民,俺有把小锄头哦`(~_~)`
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yorckzhang

金虫 (小有名气)

引用回帖:
6楼: Originally posted by chawk at 2012-01-08 21:52:46:
您好,谢谢!
我用的是周期性边界,按照您说的把计算长度改成边长的一般,还是不行。我想是前面那位说的归一化问题,但是我不知道如何归一化。。。

the normalization constant is the average density of the system, i.e. N/V. I don't think it will cause the problem. You can try VMD to calculate the PDF.
疾风知劲草,版荡识诚臣。
7楼2012-01-09 23:57:10
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shengxiang

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
chawk(金币+10): ★★★很有帮助 2012-01-08 21:48:53
jiaoyixiong(金币+5): 鼓励交流 2012-01-10 09:18:48
由于对于给定的距离找到原子的几率基本上相 同,所以g(r,r')随着|r-r'|的增大而变得平缓,最后趋向于恒值。通常定义g(r,r')时,归一化的条件为|r-r;|趋向于无穷大 时,g(r,r')趋向于一。
2楼2012-01-08 08:36:58
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huanghl2010

木虫 (著名写手)

★ ★
chaizhm(金币+2): 谢谢~ 2012-01-09 09:29:52
确定一定会收敛于1.
0肯定不对的
MOFs
3楼2012-01-08 11:40:51
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yorckzhang

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
chawk(金币+10): ★★★很有帮助 2012-01-08 21:53:10
jiaoyixiong(金币+5): 鼓励交流 2012-01-10 09:19:08
chawk(金币+10): ★★★★★最佳答案 2012-01-10 13:45:14
chawk(金币+20): ★★★★★最佳答案 2012-01-13 14:11:57
一般的rdf由于周期性边界条件,只算到盒子尺寸的一半,不知道你是不是算的超过了这个。
疾风知劲草,版荡识诚臣。
4楼2012-01-08 17:36:27
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